Protein–RNA interactions for Protein: O35711

Ppfibp2, Liprin-beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfibp2O35711 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ppfibp2O35711 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ppfibp2O35711 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ppfibp2O35711 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ppfibp2O35711 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Ppfibp2O35711 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ppfibp2O35711 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Ppfibp2O35711 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Ppfibp2O35711 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ppfibp2O35711 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ppfibp2O35711 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ppfibp2O35711 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ppfibp2O35711 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ppfibp2O35711 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ppfibp2O35711 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ppfibp2O35711 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ppfibp2O35711 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ppfibp2O35711 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ppfibp2O35711 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ppfibp2O35711 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ppfibp2O35711 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ppfibp2O35711 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ppfibp2O35711 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ppfibp2O35711 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ppfibp2O35711 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ppfibp2O35711 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Ppfibp2O35711 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ppfibp2O35711 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ppfibp2O35711 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ppfibp2O35711 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ppfibp2O35711 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ppfibp2O35711 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ppfibp2O35711 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ppfibp2O35711 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ppfibp2O35711 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ppfibp2O35711 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ppfibp2O35711 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ppfibp2O35711 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ppfibp2O35711 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Ppfibp2O35711 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Ppfibp2O35711 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ppfibp2O35711 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ppfibp2O35711 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ppfibp2O35711 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ppfibp2O35711 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ppfibp2O35711 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ppfibp2O35711 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ppfibp2O35711 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ppfibp2O35711 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ppfibp2O35711 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ppfibp2O35711 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ppfibp2O35711 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ppfibp2O35711 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Ppfibp2O35711 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Ppfibp2O35711 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Ppfibp2O35711 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Ppfibp2O35711 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ppfibp2O35711 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ppfibp2O35711 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ppfibp2O35711 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ppfibp2O35711 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ppfibp2O35711 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ppfibp2O35711 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Ppfibp2O35711 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Ppfibp2O35711 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ppfibp2O35711 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ppfibp2O35711 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ppfibp2O35711 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ppfibp2O35711 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ppfibp2O35711 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Ppfibp2O35711 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ppfibp2O35711 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ppfibp2O35711 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ppfibp2O35711 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ppfibp2O35711 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Ppfibp2O35711 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ppfibp2O35711 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ppfibp2O35711 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ppfibp2O35711 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ppfibp2O35711 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Ppfibp2O35711 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Ppfibp2O35711 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ppfibp2O35711 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Ppfibp2O35711 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ppfibp2O35711 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ppfibp2O35711 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ppfibp2O35711 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ppfibp2O35711 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ppfibp2O35711 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ppfibp2O35711 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Ppfibp2O35711 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ppfibp2O35711 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Ppfibp2O35711 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ppfibp2O35711 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Ppfibp2O35711 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Ppfibp2O35711 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ppfibp2O35711 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ppfibp2O35711 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ppfibp2O35711 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ppfibp2O35711 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms