Protein–RNA interactions for Protein: O35691

Pnn, Pinin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 725 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PnnO35691 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PnnO35691 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PnnO35691 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PnnO35691 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PnnO35691 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PnnO35691 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PnnO35691 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PnnO35691 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PnnO35691 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PnnO35691 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PnnO35691 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PnnO35691 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PnnO35691 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
PnnO35691 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PnnO35691 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PnnO35691 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PnnO35691 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PnnO35691 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PnnO35691 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PnnO35691 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PnnO35691 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PnnO35691 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PnnO35691 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PnnO35691 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PnnO35691 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PnnO35691 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PnnO35691 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PnnO35691 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PnnO35691 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PnnO35691 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PnnO35691 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PnnO35691 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PnnO35691 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PnnO35691 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PnnO35691 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PnnO35691 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PnnO35691 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PnnO35691 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PnnO35691 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PnnO35691 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PnnO35691 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PnnO35691 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PnnO35691 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PnnO35691 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PnnO35691 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PnnO35691 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PnnO35691 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PnnO35691 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PnnO35691 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PnnO35691 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PnnO35691 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PnnO35691 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PnnO35691 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PnnO35691 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PnnO35691 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PnnO35691 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PnnO35691 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PnnO35691 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PnnO35691 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PnnO35691 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PnnO35691 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PnnO35691 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PnnO35691 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PnnO35691 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PnnO35691 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PnnO35691 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PnnO35691 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PnnO35691 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PnnO35691 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PnnO35691 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PnnO35691 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PnnO35691 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PnnO35691 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PnnO35691 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PnnO35691 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PnnO35691 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PnnO35691 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PnnO35691 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PnnO35691 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PnnO35691 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PnnO35691 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PnnO35691 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PnnO35691 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PnnO35691 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PnnO35691 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PnnO35691 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PnnO35691 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PnnO35691 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PnnO35691 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PnnO35691 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PnnO35691 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PnnO35691 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PnnO35691 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PnnO35691 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PnnO35691 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PnnO35691 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PnnO35691 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PnnO35691 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PnnO35691 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PnnO35691 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms