Protein–RNA interactions for Protein: O35638

Stag2, Cohesin subunit SA-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stag2O35638 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Stag2O35638 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Stag2O35638 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Stag2O35638 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Stag2O35638 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Stag2O35638 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Stag2O35638 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Stag2O35638 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Stag2O35638 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Stag2O35638 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Stag2O35638 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Stag2O35638 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Stag2O35638 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Stag2O35638 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Stag2O35638 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Stag2O35638 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Stag2O35638 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Stag2O35638 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Stag2O35638 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Stag2O35638 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Stag2O35638 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Stag2O35638 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Stag2O35638 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Stag2O35638 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Stag2O35638 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Stag2O35638 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Stag2O35638 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Stag2O35638 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Stag2O35638 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Stag2O35638 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Stag2O35638 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Stag2O35638 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Stag2O35638 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Stag2O35638 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Stag2O35638 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Stag2O35638 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Stag2O35638 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Stag2O35638 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Stag2O35638 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Stag2O35638 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Stag2O35638 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Stag2O35638 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Stag2O35638 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Stag2O35638 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Stag2O35638 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Stag2O35638 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Stag2O35638 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Stag2O35638 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Stag2O35638 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Stag2O35638 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Stag2O35638 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Stag2O35638 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Stag2O35638 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Stag2O35638 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Stag2O35638 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Stag2O35638 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Stag2O35638 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Stag2O35638 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Stag2O35638 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Stag2O35638 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Stag2O35638 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Stag2O35638 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Stag2O35638 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Stag2O35638 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Stag2O35638 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Stag2O35638 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Stag2O35638 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Stag2O35638 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Stag2O35638 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Stag2O35638 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Stag2O35638 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Stag2O35638 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Stag2O35638 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Stag2O35638 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Stag2O35638 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Stag2O35638 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Stag2O35638 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Stag2O35638 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Stag2O35638 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Stag2O35638 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Stag2O35638 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Stag2O35638 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Stag2O35638 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Stag2O35638 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Stag2O35638 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Stag2O35638 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Stag2O35638 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Stag2O35638 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Stag2O35638 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Stag2O35638 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Stag2O35638 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Stag2O35638 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Stag2O35638 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Stag2O35638 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Stag2O35638 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Stag2O35638 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Stag2O35638 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Stag2O35638 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Stag2O35638 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Stag2O35638 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms