Protein–RNA interactions for Protein: O35449

Prrt1, Proline-rich transmembrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt1O35449 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Prrt1O35449 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Prrt1O35449 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Prrt1O35449 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prrt1O35449 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Prrt1O35449 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prrt1O35449 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prrt1O35449 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prrt1O35449 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prrt1O35449 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prrt1O35449 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prrt1O35449 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prrt1O35449 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prrt1O35449 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prrt1O35449 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prrt1O35449 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prrt1O35449 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prrt1O35449 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prrt1O35449 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prrt1O35449 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Prrt1O35449 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prrt1O35449 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prrt1O35449 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prrt1O35449 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Prrt1O35449 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prrt1O35449 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prrt1O35449 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prrt1O35449 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prrt1O35449 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prrt1O35449 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prrt1O35449 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prrt1O35449 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prrt1O35449 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prrt1O35449 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prrt1O35449 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prrt1O35449 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prrt1O35449 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prrt1O35449 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prrt1O35449 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prrt1O35449 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prrt1O35449 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prrt1O35449 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prrt1O35449 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prrt1O35449 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prrt1O35449 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prrt1O35449 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prrt1O35449 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Prrt1O35449 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prrt1O35449 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prrt1O35449 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prrt1O35449 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prrt1O35449 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prrt1O35449 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prrt1O35449 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prrt1O35449 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prrt1O35449 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prrt1O35449 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prrt1O35449 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prrt1O35449 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prrt1O35449 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prrt1O35449 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prrt1O35449 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prrt1O35449 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prrt1O35449 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prrt1O35449 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prrt1O35449 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prrt1O35449 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prrt1O35449 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prrt1O35449 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prrt1O35449 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prrt1O35449 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prrt1O35449 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prrt1O35449 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prrt1O35449 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prrt1O35449 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prrt1O35449 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prrt1O35449 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prrt1O35449 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prrt1O35449 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prrt1O35449 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prrt1O35449 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prrt1O35449 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prrt1O35449 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prrt1O35449 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prrt1O35449 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prrt1O35449 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prrt1O35449 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Prrt1O35449 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prrt1O35449 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prrt1O35449 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Prrt1O35449 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Prrt1O35449 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Prrt1O35449 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Prrt1O35449 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Prrt1O35449 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Prrt1O35449 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Prrt1O35449 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prrt1O35449 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prrt1O35449 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prrt1O35449 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms