Protein–RNA interactions for Protein: O35372

Cnih1, Protein cornichon homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih1O35372 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cnih1O35372 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cnih1O35372 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cnih1O35372 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cnih1O35372 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cnih1O35372 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cnih1O35372 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cnih1O35372 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cnih1O35372 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cnih1O35372 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cnih1O35372 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cnih1O35372 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cnih1O35372 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cnih1O35372 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cnih1O35372 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cnih1O35372 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cnih1O35372 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cnih1O35372 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cnih1O35372 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cnih1O35372 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cnih1O35372 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cnih1O35372 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnih1O35372 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnih1O35372 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnih1O35372 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnih1O35372 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnih1O35372 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnih1O35372 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnih1O35372 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnih1O35372 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnih1O35372 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnih1O35372 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnih1O35372 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnih1O35372 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnih1O35372 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnih1O35372 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnih1O35372 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnih1O35372 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnih1O35372 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnih1O35372 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnih1O35372 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnih1O35372 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnih1O35372 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnih1O35372 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnih1O35372 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cnih1O35372 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cnih1O35372 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cnih1O35372 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cnih1O35372 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cnih1O35372 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cnih1O35372 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cnih1O35372 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cnih1O35372 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cnih1O35372 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cnih1O35372 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cnih1O35372 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cnih1O35372 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Cnih1O35372 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cnih1O35372 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Cnih1O35372 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Cnih1O35372 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cnih1O35372 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cnih1O35372 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cnih1O35372 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cnih1O35372 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cnih1O35372 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cnih1O35372 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cnih1O35372 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cnih1O35372 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cnih1O35372 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cnih1O35372 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cnih1O35372 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cnih1O35372 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cnih1O35372 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cnih1O35372 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cnih1O35372 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Cnih1O35372 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cnih1O35372 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cnih1O35372 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cnih1O35372 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cnih1O35372 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cnih1O35372 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cnih1O35372 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cnih1O35372 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cnih1O35372 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cnih1O35372 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cnih1O35372 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cnih1O35372 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cnih1O35372 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cnih1O35372 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cnih1O35372 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cnih1O35372 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cnih1O35372 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cnih1O35372 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cnih1O35372 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cnih1O35372 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cnih1O35372 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cnih1O35372 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cnih1O35372 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cnih1O35372 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms