Protein–RNA interactions for Protein: O35347

Dgcr6, Protein DGCR6, mousemouse

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Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dgcr6O35347 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dgcr6O35347 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dgcr6O35347 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dgcr6O35347 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dgcr6O35347 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dgcr6O35347 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dgcr6O35347 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dgcr6O35347 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dgcr6O35347 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dgcr6O35347 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dgcr6O35347 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dgcr6O35347 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dgcr6O35347 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dgcr6O35347 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dgcr6O35347 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dgcr6O35347 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dgcr6O35347 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Dgcr6O35347 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Dgcr6O35347 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Dgcr6O35347 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Dgcr6O35347 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Dgcr6O35347 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Dgcr6O35347 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Dgcr6O35347 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Dgcr6O35347 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Dgcr6O35347 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Dgcr6O35347 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Dgcr6O35347 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Dgcr6O35347 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Dgcr6O35347 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Dgcr6O35347 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Dgcr6O35347 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dgcr6O35347 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dgcr6O35347 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dgcr6O35347 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dgcr6O35347 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dgcr6O35347 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dgcr6O35347 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dgcr6O35347 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dgcr6O35347 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Dgcr6O35347 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dgcr6O35347 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dgcr6O35347 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Dgcr6O35347 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dgcr6O35347 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dgcr6O35347 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dgcr6O35347 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dgcr6O35347 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dgcr6O35347 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dgcr6O35347 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dgcr6O35347 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Dgcr6O35347 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Dgcr6O35347 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Dgcr6O35347 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Dgcr6O35347 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Dgcr6O35347 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Dgcr6O35347 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Dgcr6O35347 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Dgcr6O35347 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Dgcr6O35347 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Dgcr6O35347 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Dgcr6O35347 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Dgcr6O35347 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Dgcr6O35347 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Dgcr6O35347 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Dgcr6O35347 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Dgcr6O35347 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
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Dgcr6O35347 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Dgcr6O35347 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Dgcr6O35347 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Dgcr6O35347 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Dgcr6O35347 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Dgcr6O35347 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Dgcr6O35347 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Dgcr6O35347 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Dgcr6O35347 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Dgcr6O35347 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Dgcr6O35347 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Dgcr6O35347 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Dgcr6O35347 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Dgcr6O35347 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Dgcr6O35347 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Dgcr6O35347 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Dgcr6O35347 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Dgcr6O35347 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Dgcr6O35347 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Dgcr6O35347 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Dgcr6O35347 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Dgcr6O35347 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Dgcr6O35347 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Dgcr6O35347 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Dgcr6O35347 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Dgcr6O35347 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Dgcr6O35347 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Dgcr6O35347 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Dgcr6O35347 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms