Protein–RNA interactions for Protein: O35308

Slc16a8, Monocarboxylate transporter 3, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc16a8O35308 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Slc16a8O35308 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Slc16a8O35308 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Slc16a8O35308 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Slc16a8O35308 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Slc16a8O35308 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Slc16a8O35308 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Slc16a8O35308 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Slc16a8O35308 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Slc16a8O35308 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Slc16a8O35308 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Slc16a8O35308 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Slc16a8O35308 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Slc16a8O35308 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Slc16a8O35308 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Slc16a8O35308 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Slc16a8O35308 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Slc16a8O35308 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Slc16a8O35308 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Slc16a8O35308 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Slc16a8O35308 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Slc16a8O35308 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Slc16a8O35308 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Slc16a8O35308 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Slc16a8O35308 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Slc16a8O35308 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Slc16a8O35308 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Slc16a8O35308 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Slc16a8O35308 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Slc16a8O35308 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Slc16a8O35308 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Slc16a8O35308 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Slc16a8O35308 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Slc16a8O35308 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Slc16a8O35308 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Slc16a8O35308 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Slc16a8O35308 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Slc16a8O35308 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Slc16a8O35308 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Slc16a8O35308 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Slc16a8O35308 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Slc16a8O35308 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Slc16a8O35308 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Slc16a8O35308 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Slc16a8O35308 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Slc16a8O35308 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Slc16a8O35308 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Slc16a8O35308 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Slc16a8O35308 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Slc16a8O35308 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Slc16a8O35308 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Slc16a8O35308 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Slc16a8O35308 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Slc16a8O35308 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Slc16a8O35308 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Slc16a8O35308 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Slc16a8O35308 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Slc16a8O35308 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Slc16a8O35308 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Slc16a8O35308 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Slc16a8O35308 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Slc16a8O35308 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Slc16a8O35308 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Slc16a8O35308 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Slc16a8O35308 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Slc16a8O35308 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
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Slc16a8O35308 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Slc16a8O35308 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Slc16a8O35308 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Slc16a8O35308 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Slc16a8O35308 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Slc16a8O35308 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Slc16a8O35308 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Slc16a8O35308 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Slc16a8O35308 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Slc16a8O35308 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Slc16a8O35308 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Slc16a8O35308 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Slc16a8O35308 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Slc16a8O35308 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Slc16a8O35308 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Slc16a8O35308 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Slc16a8O35308 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Slc16a8O35308 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Slc16a8O35308 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Slc16a8O35308 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Slc16a8O35308 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Slc16a8O35308 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Slc16a8O35308 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Slc16a8O35308 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Slc16a8O35308 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Slc16a8O35308 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Slc16a8O35308 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Slc16a8O35308 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Slc16a8O35308 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Slc16a8O35308 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Slc16a8O35308 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Slc16a8O35308 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Slc16a8O35308 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms