Protein–RNA interactions for Protein: O35261

E2f3, Transcription factor E2F3, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2f3O35261 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
E2f3O35261 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
E2f3O35261 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
E2f3O35261 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
E2f3O35261 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
E2f3O35261 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
E2f3O35261 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
E2f3O35261 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
E2f3O35261 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
E2f3O35261 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
E2f3O35261 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
E2f3O35261 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
E2f3O35261 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
E2f3O35261 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
E2f3O35261 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
E2f3O35261 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
E2f3O35261 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
E2f3O35261 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
E2f3O35261 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
E2f3O35261 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
E2f3O35261 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
E2f3O35261 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
E2f3O35261 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
E2f3O35261 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
E2f3O35261 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
E2f3O35261 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
E2f3O35261 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
E2f3O35261 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
E2f3O35261 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
E2f3O35261 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
E2f3O35261 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
E2f3O35261 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
E2f3O35261 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
E2f3O35261 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
E2f3O35261 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
E2f3O35261 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
E2f3O35261 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
E2f3O35261 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
E2f3O35261 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
E2f3O35261 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
E2f3O35261 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
E2f3O35261 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
E2f3O35261 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
E2f3O35261 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
E2f3O35261 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
E2f3O35261 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
E2f3O35261 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
E2f3O35261 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
E2f3O35261 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
E2f3O35261 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
E2f3O35261 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
E2f3O35261 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
E2f3O35261 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
E2f3O35261 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
E2f3O35261 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
E2f3O35261 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
E2f3O35261 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
E2f3O35261 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
E2f3O35261 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
E2f3O35261 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
E2f3O35261 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
E2f3O35261 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
E2f3O35261 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
E2f3O35261 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
E2f3O35261 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
E2f3O35261 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
E2f3O35261 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
E2f3O35261 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
E2f3O35261 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
E2f3O35261 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
E2f3O35261 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
E2f3O35261 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
E2f3O35261 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
E2f3O35261 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
E2f3O35261 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
E2f3O35261 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
E2f3O35261 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
E2f3O35261 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
E2f3O35261 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
E2f3O35261 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
E2f3O35261 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
E2f3O35261 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
E2f3O35261 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
E2f3O35261 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
E2f3O35261 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
E2f3O35261 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
E2f3O35261 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
E2f3O35261 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
E2f3O35261 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
E2f3O35261 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
E2f3O35261 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
E2f3O35261 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
E2f3O35261 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
E2f3O35261 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
E2f3O35261 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
E2f3O35261 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
E2f3O35261 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
E2f3O35261 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
E2f3O35261 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
E2f3O35261 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms