Protein–RNA interactions for Protein: O35134

Polr1a, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1aO35134 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Polr1aO35134 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Polr1aO35134 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Polr1aO35134 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Polr1aO35134 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Polr1aO35134 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Polr1aO35134 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Polr1aO35134 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Polr1aO35134 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Polr1aO35134 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Polr1aO35134 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Polr1aO35134 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Polr1aO35134 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Polr1aO35134 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Polr1aO35134 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
Polr1aO35134 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
Polr1aO35134 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Polr1aO35134 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Polr1aO35134 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Polr1aO35134 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Polr1aO35134 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Polr1aO35134 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
Polr1aO35134 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Polr1aO35134 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Polr1aO35134 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Polr1aO35134 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Polr1aO35134 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Polr1aO35134 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Polr1aO35134 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Polr1aO35134 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Polr1aO35134 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Polr1aO35134 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Polr1aO35134 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Polr1aO35134 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Polr1aO35134 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Polr1aO35134 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Polr1aO35134 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Polr1aO35134 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Polr1aO35134 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Polr1aO35134 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Polr1aO35134 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Polr1aO35134 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Polr1aO35134 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
Polr1aO35134 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Polr1aO35134 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Polr1aO35134 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
Polr1aO35134 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Polr1aO35134 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
Polr1aO35134 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Polr1aO35134 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Polr1aO35134 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
Polr1aO35134 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
Polr1aO35134 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Polr1aO35134 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Polr1aO35134 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Polr1aO35134 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Polr1aO35134 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Polr1aO35134 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
Polr1aO35134 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Polr1aO35134 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Polr1aO35134 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Polr1aO35134 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Polr1aO35134 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
Polr1aO35134 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.01■■■□□ 2.24
Polr1aO35134 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Polr1aO35134 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Polr1aO35134 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Polr1aO35134 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Polr1aO35134 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Polr1aO35134 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Polr1aO35134 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC29■■■□□ 2.23
Polr1aO35134 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Polr1aO35134 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Polr1aO35134 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Polr1aO35134 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Polr1aO35134 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC29■■■□□ 2.23
Polr1aO35134 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Polr1aO35134 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Polr1aO35134 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
Polr1aO35134 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Polr1aO35134 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Polr1aO35134 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Polr1aO35134 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Polr1aO35134 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Polr1aO35134 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Polr1aO35134 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Polr1aO35134 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Polr1aO35134 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Polr1aO35134 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Polr1aO35134 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
Polr1aO35134 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Polr1aO35134 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Polr1aO35134 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
Polr1aO35134 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Polr1aO35134 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Polr1aO35134 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Polr1aO35134 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Polr1aO35134 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Polr1aO35134 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Polr1aO35134 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms