Protein–RNA interactions for Protein: O35085

Arx, Homeobox protein ARX, mousemouse

Predictions only

Length 564 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ArxO35085 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ArxO35085 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ArxO35085 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ArxO35085 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ArxO35085 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ArxO35085 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
ArxO35085 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ArxO35085 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ArxO35085 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ArxO35085 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ArxO35085 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ArxO35085 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ArxO35085 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ArxO35085 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ArxO35085 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ArxO35085 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ArxO35085 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ArxO35085 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ArxO35085 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ArxO35085 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ArxO35085 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ArxO35085 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ArxO35085 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ArxO35085 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ArxO35085 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ArxO35085 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ArxO35085 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ArxO35085 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ArxO35085 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ArxO35085 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ArxO35085 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ArxO35085 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ArxO35085 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ArxO35085 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ArxO35085 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ArxO35085 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ArxO35085 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ArxO35085 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
ArxO35085 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ArxO35085 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ArxO35085 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
ArxO35085 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ArxO35085 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ArxO35085 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ArxO35085 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ArxO35085 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ArxO35085 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ArxO35085 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ArxO35085 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ArxO35085 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ArxO35085 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ArxO35085 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ArxO35085 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ArxO35085 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
ArxO35085 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
ArxO35085 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
ArxO35085 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ArxO35085 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ArxO35085 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ArxO35085 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ArxO35085 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
ArxO35085 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ArxO35085 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ArxO35085 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
ArxO35085 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ArxO35085 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ArxO35085 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
ArxO35085 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ArxO35085 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ArxO35085 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ArxO35085 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ArxO35085 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ArxO35085 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ArxO35085 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ArxO35085 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ArxO35085 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ArxO35085 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ArxO35085 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ArxO35085 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ArxO35085 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ArxO35085 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ArxO35085 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ArxO35085 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ArxO35085 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ArxO35085 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ArxO35085 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ArxO35085 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ArxO35085 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ArxO35085 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ArxO35085 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ArxO35085 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
ArxO35085 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ArxO35085 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
ArxO35085 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ArxO35085 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ArxO35085 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ArxO35085 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ArxO35085 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ArxO35085 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ArxO35085 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms