Protein–RNA interactions for Protein: O09165

Casq1, Calsequestrin-1, mousemouse

Predictions only

Length 405 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casq1O09165 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Casq1O09165 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Casq1O09165 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Casq1O09165 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Casq1O09165 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Casq1O09165 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Casq1O09165 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Casq1O09165 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Casq1O09165 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Casq1O09165 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Casq1O09165 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Casq1O09165 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Casq1O09165 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Casq1O09165 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Casq1O09165 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Casq1O09165 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Casq1O09165 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Casq1O09165 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Casq1O09165 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Casq1O09165 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Casq1O09165 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Casq1O09165 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Casq1O09165 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Casq1O09165 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Casq1O09165 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Casq1O09165 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Casq1O09165 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Casq1O09165 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Casq1O09165 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Casq1O09165 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Casq1O09165 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Casq1O09165 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Casq1O09165 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Casq1O09165 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Casq1O09165 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Casq1O09165 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Casq1O09165 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Casq1O09165 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Casq1O09165 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Casq1O09165 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Casq1O09165 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Casq1O09165 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Casq1O09165 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Casq1O09165 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Casq1O09165 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Casq1O09165 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Casq1O09165 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Casq1O09165 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Casq1O09165 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Casq1O09165 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Casq1O09165 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Casq1O09165 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Casq1O09165 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Casq1O09165 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Casq1O09165 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Casq1O09165 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Casq1O09165 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Casq1O09165 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Casq1O09165 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Casq1O09165 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Casq1O09165 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Casq1O09165 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Casq1O09165 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Casq1O09165 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Casq1O09165 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Casq1O09165 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Casq1O09165 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Casq1O09165 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Casq1O09165 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Casq1O09165 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Casq1O09165 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Casq1O09165 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Casq1O09165 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Casq1O09165 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Casq1O09165 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Casq1O09165 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Casq1O09165 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Casq1O09165 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Casq1O09165 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Casq1O09165 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Casq1O09165 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Casq1O09165 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Casq1O09165 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Casq1O09165 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Casq1O09165 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Casq1O09165 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Casq1O09165 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Casq1O09165 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Casq1O09165 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Casq1O09165 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Casq1O09165 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Casq1O09165 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Casq1O09165 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Casq1O09165 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Casq1O09165 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Casq1O09165 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Casq1O09165 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Casq1O09165 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Casq1O09165 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Casq1O09165 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
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