Protein–RNA interactions for Protein: O08842

Gfra2, GDNF family receptor alpha-2, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra2O08842 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Gfra2O08842 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gfra2O08842 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gfra2O08842 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gfra2O08842 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gfra2O08842 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Gfra2O08842 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gfra2O08842 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gfra2O08842 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gfra2O08842 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gfra2O08842 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gfra2O08842 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gfra2O08842 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gfra2O08842 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gfra2O08842 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gfra2O08842 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gfra2O08842 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gfra2O08842 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gfra2O08842 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gfra2O08842 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gfra2O08842 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gfra2O08842 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gfra2O08842 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gfra2O08842 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gfra2O08842 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Gfra2O08842 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gfra2O08842 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gfra2O08842 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gfra2O08842 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gfra2O08842 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gfra2O08842 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gfra2O08842 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gfra2O08842 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gfra2O08842 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gfra2O08842 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gfra2O08842 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gfra2O08842 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gfra2O08842 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gfra2O08842 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gfra2O08842 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gfra2O08842 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gfra2O08842 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gfra2O08842 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gfra2O08842 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gfra2O08842 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gfra2O08842 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gfra2O08842 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gfra2O08842 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gfra2O08842 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Gfra2O08842 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gfra2O08842 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gfra2O08842 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gfra2O08842 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gfra2O08842 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gfra2O08842 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gfra2O08842 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gfra2O08842 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gfra2O08842 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gfra2O08842 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Gfra2O08842 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Gfra2O08842 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gfra2O08842 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gfra2O08842 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Gfra2O08842 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gfra2O08842 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gfra2O08842 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gfra2O08842 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gfra2O08842 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gfra2O08842 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gfra2O08842 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gfra2O08842 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gfra2O08842 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gfra2O08842 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Gfra2O08842 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gfra2O08842 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gfra2O08842 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gfra2O08842 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gfra2O08842 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gfra2O08842 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gfra2O08842 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gfra2O08842 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gfra2O08842 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gfra2O08842 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gfra2O08842 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gfra2O08842 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gfra2O08842 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gfra2O08842 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gfra2O08842 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gfra2O08842 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gfra2O08842 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gfra2O08842 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gfra2O08842 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gfra2O08842 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gfra2O08842 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gfra2O08842 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gfra2O08842 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gfra2O08842 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gfra2O08842 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gfra2O08842 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gfra2O08842 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms