Protein–RNA interactions for Protein: O08788

Dctn1, Dynactin subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dctn1O08788 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Dctn1O08788 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Dctn1O08788 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Dctn1O08788 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Dctn1O08788 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Dctn1O08788 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Dctn1O08788 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Dctn1O08788 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Dctn1O08788 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Dctn1O08788 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Dctn1O08788 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Dctn1O08788 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Dctn1O08788 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Dctn1O08788 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Dctn1O08788 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Dctn1O08788 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Dctn1O08788 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Dctn1O08788 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Dctn1O08788 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Dctn1O08788 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Dctn1O08788 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Dctn1O08788 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Dctn1O08788 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Dctn1O08788 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Dctn1O08788 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Dctn1O08788 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Dctn1O08788 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Dctn1O08788 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Dctn1O08788 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Dctn1O08788 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Dctn1O08788 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Dctn1O08788 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Dctn1O08788 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Dctn1O08788 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Dctn1O08788 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Dctn1O08788 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Dctn1O08788 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Dctn1O08788 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Dctn1O08788 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Dctn1O08788 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Dctn1O08788 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Dctn1O08788 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Dctn1O08788 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Dctn1O08788 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Dctn1O08788 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Dctn1O08788 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Dctn1O08788 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Dctn1O08788 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Dctn1O08788 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Dctn1O08788 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Dctn1O08788 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Dctn1O08788 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Dctn1O08788 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Dctn1O08788 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Dctn1O08788 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Dctn1O08788 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Dctn1O08788 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Dctn1O08788 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Dctn1O08788 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Dctn1O08788 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Dctn1O08788 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Dctn1O08788 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Dctn1O08788 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Dctn1O08788 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Dctn1O08788 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Dctn1O08788 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Dctn1O08788 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Dctn1O08788 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Dctn1O08788 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Dctn1O08788 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Dctn1O08788 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Dctn1O08788 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Dctn1O08788 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Dctn1O08788 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Dctn1O08788 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Dctn1O08788 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Dctn1O08788 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Dctn1O08788 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Dctn1O08788 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Dctn1O08788 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Dctn1O08788 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Dctn1O08788 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Dctn1O08788 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Dctn1O08788 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Dctn1O08788 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Dctn1O08788 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Dctn1O08788 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Dctn1O08788 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Dctn1O08788 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Dctn1O08788 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Dctn1O08788 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Dctn1O08788 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Dctn1O08788 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Dctn1O08788 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Dctn1O08788 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Dctn1O08788 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Dctn1O08788 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Dctn1O08788 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Dctn1O08788 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Dctn1O08788 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms