Protein–RNA interactions for Protein: O08585

Clta, Clathrin light chain A, mousemouse

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Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltaO08585 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CltaO08585 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CltaO08585 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CltaO08585 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CltaO08585 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CltaO08585 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CltaO08585 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CltaO08585 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CltaO08585 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CltaO08585 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CltaO08585 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CltaO08585 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CltaO08585 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CltaO08585 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CltaO08585 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CltaO08585 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CltaO08585 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CltaO08585 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CltaO08585 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CltaO08585 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CltaO08585 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CltaO08585 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CltaO08585 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CltaO08585 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CltaO08585 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CltaO08585 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CltaO08585 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CltaO08585 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CltaO08585 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CltaO08585 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CltaO08585 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CltaO08585 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CltaO08585 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CltaO08585 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CltaO08585 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CltaO08585 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CltaO08585 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CltaO08585 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CltaO08585 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CltaO08585 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CltaO08585 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CltaO08585 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CltaO08585 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CltaO08585 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CltaO08585 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CltaO08585 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CltaO08585 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CltaO08585 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CltaO08585 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CltaO08585 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CltaO08585 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CltaO08585 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CltaO08585 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CltaO08585 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CltaO08585 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CltaO08585 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CltaO08585 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CltaO08585 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CltaO08585 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CltaO08585 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CltaO08585 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CltaO08585 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CltaO08585 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CltaO08585 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CltaO08585 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CltaO08585 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CltaO08585 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CltaO08585 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CltaO08585 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CltaO08585 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CltaO08585 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CltaO08585 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CltaO08585 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CltaO08585 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CltaO08585 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CltaO08585 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CltaO08585 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CltaO08585 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CltaO08585 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CltaO08585 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CltaO08585 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CltaO08585 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CltaO08585 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CltaO08585 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CltaO08585 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CltaO08585 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CltaO08585 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CltaO08585 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CltaO08585 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CltaO08585 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CltaO08585 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CltaO08585 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CltaO08585 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CltaO08585 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CltaO08585 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CltaO08585 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CltaO08585 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CltaO08585 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CltaO08585 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CltaO08585 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms