Protein–RNA interactions for Protein: L7N244

Gm20878, Predicted gene, 20878, mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20878L7N244 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm20878L7N244 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm20878L7N244 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm20878L7N244 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm20878L7N244 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm20878L7N244 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm20878L7N244 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm20878L7N244 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm20878L7N244 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm20878L7N244 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm20878L7N244 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Gm20878L7N244 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Gm20878L7N244 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Gm20878L7N244 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm20878L7N244 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm20878L7N244 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm20878L7N244 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm20878L7N244 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm20878L7N244 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm20878L7N244 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm20878L7N244 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm20878L7N244 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm20878L7N244 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm20878L7N244 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm20878L7N244 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm20878L7N244 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm20878L7N244 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm20878L7N244 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm20878L7N244 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm20878L7N244 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm20878L7N244 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm20878L7N244 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm20878L7N244 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm20878L7N244 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm20878L7N244 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm20878L7N244 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm20878L7N244 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm20878L7N244 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm20878L7N244 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm20878L7N244 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm20878L7N244 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm20878L7N244 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm20878L7N244 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm20878L7N244 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm20878L7N244 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm20878L7N244 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm20878L7N244 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm20878L7N244 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm20878L7N244 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm20878L7N244 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm20878L7N244 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm20878L7N244 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm20878L7N244 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm20878L7N244 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm20878L7N244 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm20878L7N244 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm20878L7N244 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm20878L7N244 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm20878L7N244 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm20878L7N244 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm20878L7N244 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm20878L7N244 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm20878L7N244 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm20878L7N244 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm20878L7N244 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm20878L7N244 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm20878L7N244 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm20878L7N244 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm20878L7N244 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm20878L7N244 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm20878L7N244 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm20878L7N244 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm20878L7N244 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm20878L7N244 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm20878L7N244 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm20878L7N244 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm20878L7N244 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm20878L7N244 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm20878L7N244 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm20878L7N244 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm20878L7N244 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm20878L7N244 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm20878L7N244 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm20878L7N244 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm20878L7N244 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm20878L7N244 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm20878L7N244 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm20878L7N244 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm20878L7N244 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm20878L7N244 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm20878L7N244 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm20878L7N244 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm20878L7N244 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm20878L7N244 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm20878L7N244 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm20878L7N244 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm20878L7N244 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm20878L7N244 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm20878L7N244 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm20878L7N244 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
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