Protein–RNA interactions for Protein: L7N216

Speer4d, Spermatogenesis-associated glutamate (E)-rich protein 4D, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer4dL7N216 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Speer4dL7N216 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Speer4dL7N216 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Speer4dL7N216 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Speer4dL7N216 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Speer4dL7N216 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Speer4dL7N216 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Speer4dL7N216 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Speer4dL7N216 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Speer4dL7N216 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Speer4dL7N216 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Speer4dL7N216 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Speer4dL7N216 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Speer4dL7N216 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Speer4dL7N216 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Speer4dL7N216 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Speer4dL7N216 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Speer4dL7N216 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Speer4dL7N216 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Speer4dL7N216 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Speer4dL7N216 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Speer4dL7N216 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Speer4dL7N216 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Speer4dL7N216 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Speer4dL7N216 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Speer4dL7N216 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Speer4dL7N216 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Speer4dL7N216 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Speer4dL7N216 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Speer4dL7N216 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Speer4dL7N216 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Speer4dL7N216 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Speer4dL7N216 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Speer4dL7N216 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Speer4dL7N216 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Speer4dL7N216 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Speer4dL7N216 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Speer4dL7N216 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Speer4dL7N216 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Speer4dL7N216 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Speer4dL7N216 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Speer4dL7N216 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Speer4dL7N216 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Speer4dL7N216 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Speer4dL7N216 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Speer4dL7N216 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Speer4dL7N216 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Speer4dL7N216 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Speer4dL7N216 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Speer4dL7N216 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Speer4dL7N216 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Speer4dL7N216 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Speer4dL7N216 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Speer4dL7N216 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Speer4dL7N216 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Speer4dL7N216 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Speer4dL7N216 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Speer4dL7N216 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Speer4dL7N216 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Speer4dL7N216 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Speer4dL7N216 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Speer4dL7N216 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Speer4dL7N216 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Speer4dL7N216 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Speer4dL7N216 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Speer4dL7N216 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Speer4dL7N216 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Speer4dL7N216 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Speer4dL7N216 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Speer4dL7N216 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Speer4dL7N216 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Speer4dL7N216 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Speer4dL7N216 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Speer4dL7N216 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Speer4dL7N216 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Speer4dL7N216 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Speer4dL7N216 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Speer4dL7N216 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Speer4dL7N216 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Speer4dL7N216 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Speer4dL7N216 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Speer4dL7N216 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Speer4dL7N216 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Speer4dL7N216 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Speer4dL7N216 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Speer4dL7N216 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Speer4dL7N216 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Speer4dL7N216 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Speer4dL7N216 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Speer4dL7N216 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Speer4dL7N216 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Speer4dL7N216 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Speer4dL7N216 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Speer4dL7N216 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Speer4dL7N216 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Speer4dL7N216 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Speer4dL7N216 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Speer4dL7N216 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Speer4dL7N216 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Speer4dL7N216 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms