Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ04

Gm21887, Predicted gene, 21887, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21887J3QQ04 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Gm21887J3QQ04 Zwilch-209ENSMUST00000176299 1831 ntTSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Gm21887J3QQ04 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Gm21887J3QQ04 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Gm21887J3QQ04 Dcpp3-201ENSMUST00000115428 610 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Gm21887J3QQ04 Gm5909-201ENSMUST00000119768 1281 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
Gm21887J3QQ04 Gm13487-201ENSMUST00000122240 864 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
Gm21887J3QQ04 1700027A07Rik-201ENSMUST00000150472 458 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Gm21887J3QQ04 Nrxn1-214ENSMUST00000173222 859 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Gm21887J3QQ04 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
Gm21887J3QQ04 Psmb7-201ENSMUST00000028083 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Gm21887J3QQ04 Olfr510-201ENSMUST00000076289 945 ntAPPRIS P1 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Gm21887J3QQ04 Mrgpra4-201ENSMUST00000087092 1259 ntAPPRIS P1 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Gm21887J3QQ04 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
Gm21887J3QQ04 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Gm21887J3QQ04 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Gm21887J3QQ04 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Gm21887J3QQ04 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Gm21887J3QQ04 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Gm21887J3QQ04 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Gm21887J3QQ04 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Gm21887J3QQ04 Rd3l-202ENSMUST00000185354 1541 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Gm21887J3QQ04 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Gm21887J3QQ04 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Gm21887J3QQ04 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Gm21887J3QQ04 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Gm21887J3QQ04 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Gm21887J3QQ04 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Gm21887J3QQ04 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Gm21887J3QQ04 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Gm21887J3QQ04 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Gm21887J3QQ04 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Gm21887J3QQ04 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Gm21887J3QQ04 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Gm21887J3QQ04 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Gm21887J3QQ04 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Gm21887J3QQ04 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Gm21887J3QQ04 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Gm21887J3QQ04 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Gm21887J3QQ04 Gm40655-201ENSMUST00000220802 1880 ntTSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Gm21887J3QQ04 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Gm21887J3QQ04 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Gm21887J3QQ04 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Gm21887J3QQ04 Gm15940-201ENSMUST00000156011 817 ntTSL 3 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Gm21887J3QQ04 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Gm21887J3QQ04 Gm20274-201ENSMUST00000206967 584 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
Gm21887J3QQ04 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Gm21887J3QQ04 Gm14005-208ENSMUST00000223654 681 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
Gm21887J3QQ04 AC154730.1-201ENSMUST00000227874 816 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
Gm21887J3QQ04 Gabrb2-205ENSMUST00000192403 1539 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Gm21887J3QQ04 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Gm21887J3QQ04 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Gm21887J3QQ04 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Gm21887J3QQ04 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Gm21887J3QQ04 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Gm21887J3QQ04 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Gm21887J3QQ04 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Gm21887J3QQ04 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Gm21887J3QQ04 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC9.02□□□□□ -0.96
Gm21887J3QQ04 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.96
Gm21887J3QQ04 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.96
Gm21887J3QQ04 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC9.02□□□□□ -0.96
Gm21887J3QQ04 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.96
Gm21887J3QQ04 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Gm21887J3QQ04 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Gm21887J3QQ04 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Gm21887J3QQ04 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Gm21887J3QQ04 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Gm21887J3QQ04 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Gm21887J3QQ04 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Gm21887J3QQ04 Gm22588-201ENSMUST00000157510 140 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
Gm21887J3QQ04 Ppp1r2-ps9-202ENSMUST00000173852 882 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
Gm21887J3QQ04 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Gm21887J3QQ04 Vmn1r206-201ENSMUST00000187140 1135 ntAPPRIS P1 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Gm21887J3QQ04 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Gm21887J3QQ04 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Gm21887J3QQ04 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Gm21887J3QQ04 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Gm21887J3QQ04 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Gm21887J3QQ04 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Gm21887J3QQ04 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Gm21887J3QQ04 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Gm21887J3QQ04 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Gm21887J3QQ04 Mta1-202ENSMUST00000069690 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Gm21887J3QQ04 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Gm21887J3QQ04 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Gm21887J3QQ04 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Gm21887J3QQ04 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Gm21887J3QQ04 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Gm21887J3QQ04 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Gm21887J3QQ04 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Gm21887J3QQ04 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Gm21887J3QQ04 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Gm21887J3QQ04 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Gm21887J3QQ04 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Gm21887J3QQ04 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Gm21887J3QQ04 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Gm21887J3QQ04 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Gm21887J3QQ04 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Gm21887J3QQ04 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms