Protein–RNA interactions for Protein: J3QPU5

Ccer2, Coiled-coil glutamate-rich protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccer2J3QPU5 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ccer2J3QPU5 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ccer2J3QPU5 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ccer2J3QPU5 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ccer2J3QPU5 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ccer2J3QPU5 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ccer2J3QPU5 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Ccer2J3QPU5 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ccer2J3QPU5 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ccer2J3QPU5 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ccer2J3QPU5 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ccer2J3QPU5 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ccer2J3QPU5 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Ccer2J3QPU5 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ccer2J3QPU5 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ccer2J3QPU5 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ccer2J3QPU5 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ccer2J3QPU5 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ccer2J3QPU5 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ccer2J3QPU5 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ccer2J3QPU5 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ccer2J3QPU5 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ccer2J3QPU5 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ccer2J3QPU5 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ccer2J3QPU5 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
Ccer2J3QPU5 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ccer2J3QPU5 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ccer2J3QPU5 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ccer2J3QPU5 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ccer2J3QPU5 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Ccer2J3QPU5 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Ccer2J3QPU5 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Ccer2J3QPU5 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Ccer2J3QPU5 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ccer2J3QPU5 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Ccer2J3QPU5 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Ccer2J3QPU5 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ccer2J3QPU5 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Ccer2J3QPU5 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ccer2J3QPU5 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ccer2J3QPU5 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ccer2J3QPU5 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Ccer2J3QPU5 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ccer2J3QPU5 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Ccer2J3QPU5 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ccer2J3QPU5 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ccer2J3QPU5 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ccer2J3QPU5 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ccer2J3QPU5 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ccer2J3QPU5 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ccer2J3QPU5 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ccer2J3QPU5 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ccer2J3QPU5 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ccer2J3QPU5 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ccer2J3QPU5 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Ccer2J3QPU5 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ccer2J3QPU5 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ccer2J3QPU5 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ccer2J3QPU5 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ccer2J3QPU5 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ccer2J3QPU5 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ccer2J3QPU5 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ccer2J3QPU5 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ccer2J3QPU5 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ccer2J3QPU5 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ccer2J3QPU5 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ccer2J3QPU5 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ccer2J3QPU5 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ccer2J3QPU5 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Ccer2J3QPU5 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ccer2J3QPU5 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ccer2J3QPU5 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ccer2J3QPU5 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ccer2J3QPU5 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ccer2J3QPU5 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ccer2J3QPU5 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Ccer2J3QPU5 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Ccer2J3QPU5 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Ccer2J3QPU5 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ccer2J3QPU5 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ccer2J3QPU5 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ccer2J3QPU5 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ccer2J3QPU5 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ccer2J3QPU5 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ccer2J3QPU5 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Ccer2J3QPU5 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ccer2J3QPU5 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ccer2J3QPU5 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ccer2J3QPU5 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ccer2J3QPU5 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ccer2J3QPU5 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ccer2J3QPU5 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ccer2J3QPU5 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
Ccer2J3QPU5 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ccer2J3QPU5 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ccer2J3QPU5 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ccer2J3QPU5 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ccer2J3QPU5 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ccer2J3QPU5 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ccer2J3QPU5 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.9 ms