Protein–RNA interactions for Protein: J3QPJ5

Gm21776, Predicted gene, 21776, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21776J3QPJ5 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm21776J3QPJ5 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm21776J3QPJ5 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm21776J3QPJ5 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm21776J3QPJ5 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm21776J3QPJ5 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm21776J3QPJ5 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm21776J3QPJ5 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm21776J3QPJ5 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm21776J3QPJ5 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm21776J3QPJ5 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm21776J3QPJ5 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm21776J3QPJ5 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm21776J3QPJ5 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm21776J3QPJ5 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm21776J3QPJ5 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm21776J3QPJ5 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm21776J3QPJ5 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm21776J3QPJ5 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm21776J3QPJ5 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm21776J3QPJ5 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm21776J3QPJ5 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm21776J3QPJ5 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm21776J3QPJ5 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm21776J3QPJ5 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm21776J3QPJ5 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm21776J3QPJ5 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm21776J3QPJ5 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm21776J3QPJ5 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm21776J3QPJ5 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm21776J3QPJ5 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm21776J3QPJ5 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm21776J3QPJ5 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm21776J3QPJ5 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm21776J3QPJ5 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm21776J3QPJ5 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm21776J3QPJ5 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm21776J3QPJ5 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm21776J3QPJ5 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm21776J3QPJ5 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm21776J3QPJ5 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm21776J3QPJ5 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm21776J3QPJ5 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm21776J3QPJ5 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm21776J3QPJ5 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm21776J3QPJ5 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm21776J3QPJ5 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm21776J3QPJ5 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm21776J3QPJ5 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm21776J3QPJ5 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm21776J3QPJ5 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm21776J3QPJ5 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm21776J3QPJ5 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm21776J3QPJ5 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm21776J3QPJ5 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm21776J3QPJ5 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm21776J3QPJ5 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm21776J3QPJ5 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm21776J3QPJ5 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm21776J3QPJ5 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm21776J3QPJ5 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm21776J3QPJ5 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm21776J3QPJ5 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm21776J3QPJ5 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm21776J3QPJ5 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm21776J3QPJ5 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm21776J3QPJ5 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm21776J3QPJ5 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm21776J3QPJ5 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm21776J3QPJ5 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm21776J3QPJ5 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm21776J3QPJ5 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm21776J3QPJ5 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm21776J3QPJ5 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm21776J3QPJ5 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm21776J3QPJ5 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm21776J3QPJ5 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm21776J3QPJ5 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm21776J3QPJ5 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm21776J3QPJ5 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm21776J3QPJ5 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm21776J3QPJ5 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm21776J3QPJ5 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm21776J3QPJ5 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm21776J3QPJ5 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm21776J3QPJ5 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm21776J3QPJ5 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm21776J3QPJ5 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm21776J3QPJ5 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm21776J3QPJ5 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm21776J3QPJ5 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm21776J3QPJ5 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm21776J3QPJ5 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm21776J3QPJ5 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm21776J3QPJ5 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm21776J3QPJ5 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm21776J3QPJ5 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm21776J3QPJ5 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm21776J3QPJ5 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm21776J3QPJ5 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms