Protein–RNA interactions for Protein: J3QPD5

Gm9602, Predicted gene 9602, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm9602J3QPD5 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm9602J3QPD5 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm9602J3QPD5 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm9602J3QPD5 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm9602J3QPD5 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm9602J3QPD5 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm9602J3QPD5 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm9602J3QPD5 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm9602J3QPD5 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm9602J3QPD5 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm9602J3QPD5 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm9602J3QPD5 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm9602J3QPD5 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm9602J3QPD5 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm9602J3QPD5 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm9602J3QPD5 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm9602J3QPD5 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm9602J3QPD5 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm9602J3QPD5 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gm9602J3QPD5 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm9602J3QPD5 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm9602J3QPD5 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm9602J3QPD5 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm9602J3QPD5 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm9602J3QPD5 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm9602J3QPD5 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm9602J3QPD5 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm9602J3QPD5 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm9602J3QPD5 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm9602J3QPD5 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm9602J3QPD5 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm9602J3QPD5 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm9602J3QPD5 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm9602J3QPD5 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm9602J3QPD5 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm9602J3QPD5 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm9602J3QPD5 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm9602J3QPD5 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm9602J3QPD5 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm9602J3QPD5 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm9602J3QPD5 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm9602J3QPD5 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm9602J3QPD5 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm9602J3QPD5 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm9602J3QPD5 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Gm9602J3QPD5 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm9602J3QPD5 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm9602J3QPD5 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Gm9602J3QPD5 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Gm9602J3QPD5 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm9602J3QPD5 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Gm9602J3QPD5 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Gm9602J3QPD5 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Gm9602J3QPD5 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Gm9602J3QPD5 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm9602J3QPD5 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm9602J3QPD5 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm9602J3QPD5 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm9602J3QPD5 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm9602J3QPD5 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm9602J3QPD5 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm9602J3QPD5 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm9602J3QPD5 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm9602J3QPD5 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm9602J3QPD5 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm9602J3QPD5 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm9602J3QPD5 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm9602J3QPD5 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm9602J3QPD5 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm9602J3QPD5 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm9602J3QPD5 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm9602J3QPD5 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC15□□□□□ -0.01
Gm9602J3QPD5 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm9602J3QPD5 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm9602J3QPD5 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm9602J3QPD5 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm9602J3QPD5 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm9602J3QPD5 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm9602J3QPD5 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Gm9602J3QPD5 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm9602J3QPD5 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm9602J3QPD5 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm9602J3QPD5 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm9602J3QPD5 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm9602J3QPD5 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm9602J3QPD5 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm9602J3QPD5 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm9602J3QPD5 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm9602J3QPD5 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm9602J3QPD5 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm9602J3QPD5 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm9602J3QPD5 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm9602J3QPD5 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm9602J3QPD5 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm9602J3QPD5 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm9602J3QPD5 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm9602J3QPD5 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm9602J3QPD5 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm9602J3QPD5 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm9602J3QPD5 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms