Protein–RNA interactions for Protein: J3QNE4

Ccdc180, Coiled-coil domain-containing 180, mousemouse

Predictions only

Length 1,664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc180J3QNE4 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Ccdc180J3QNE4 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Ccdc180J3QNE4 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Ccdc180J3QNE4 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Ccdc180J3QNE4 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC34.29■■■■□ 3.08
Ccdc180J3QNE4 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Ccdc180J3QNE4 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Ccdc180J3QNE4 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC34.29■■■■□ 3.08
Ccdc180J3QNE4 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Ccdc180J3QNE4 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC34.29■■■■□ 3.08
Ccdc180J3QNE4 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Ccdc180J3QNE4 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Ccdc180J3QNE4 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Ccdc180J3QNE4 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Ccdc180J3QNE4 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Ccdc180J3QNE4 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
Ccdc180J3QNE4 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Ccdc180J3QNE4 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Ccdc180J3QNE4 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Ccdc180J3QNE4 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Ccdc180J3QNE4 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
Ccdc180J3QNE4 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC34.28■■■■□ 3.08
Ccdc180J3QNE4 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Ccdc180J3QNE4 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Ccdc180J3QNE4 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC34.28■■■■□ 3.08
Ccdc180J3QNE4 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Ccdc180J3QNE4 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Ccdc180J3QNE4 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Ccdc180J3QNE4 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Ccdc180J3QNE4 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
Ccdc180J3QNE4 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
Ccdc180J3QNE4 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC34.28■■■■□ 3.08
Ccdc180J3QNE4 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Ccdc180J3QNE4 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Ccdc180J3QNE4 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Ccdc180J3QNE4 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC34.27■■■■□ 3.08
Ccdc180J3QNE4 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Ccdc180J3QNE4 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Ccdc180J3QNE4 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Ccdc180J3QNE4 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
Ccdc180J3QNE4 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
Ccdc180J3QNE4 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
Ccdc180J3QNE4 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
Ccdc180J3QNE4 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
Ccdc180J3QNE4 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC34.25■■■■□ 3.07
Ccdc180J3QNE4 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Ccdc180J3QNE4 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Ccdc180J3QNE4 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Ccdc180J3QNE4 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Ccdc180J3QNE4 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Ccdc180J3QNE4 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Ccdc180J3QNE4 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Ccdc180J3QNE4 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Ccdc180J3QNE4 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC34.25■■■■□ 3.07
Ccdc180J3QNE4 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Ccdc180J3QNE4 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Ccdc180J3QNE4 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Ccdc180J3QNE4 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC34.24■■■■□ 3.07
Ccdc180J3QNE4 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Ccdc180J3QNE4 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Ccdc180J3QNE4 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
Ccdc180J3QNE4 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
Ccdc180J3QNE4 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
Ccdc180J3QNE4 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
Ccdc180J3QNE4 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
Ccdc180J3QNE4 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
Ccdc180J3QNE4 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
Ccdc180J3QNE4 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
Ccdc180J3QNE4 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Ccdc180J3QNE4 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC34.22■■■■□ 3.07
Ccdc180J3QNE4 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC34.22■■■■□ 3.07
Ccdc180J3QNE4 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Ccdc180J3QNE4 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Ccdc180J3QNE4 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
Ccdc180J3QNE4 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Ccdc180J3QNE4 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
Ccdc180J3QNE4 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Ccdc180J3QNE4 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC34.22■■■■□ 3.07
Ccdc180J3QNE4 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Ccdc180J3QNE4 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Ccdc180J3QNE4 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Ccdc180J3QNE4 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Ccdc180J3QNE4 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Ccdc180J3QNE4 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Ccdc180J3QNE4 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Ccdc180J3QNE4 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
Ccdc180J3QNE4 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
Ccdc180J3QNE4 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
Ccdc180J3QNE4 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
Ccdc180J3QNE4 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.07
Ccdc180J3QNE4 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
Ccdc180J3QNE4 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC34.2■■■■□ 3.06
Ccdc180J3QNE4 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.06
Ccdc180J3QNE4 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
Ccdc180J3QNE4 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Ccdc180J3QNE4 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC34.19■■■■□ 3.06
Ccdc180J3QNE4 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Ccdc180J3QNE4 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Ccdc180J3QNE4 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
Ccdc180J3QNE4 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms