Protein–RNA interactions for Protein: J3KMU2

Gm21820, Predicted gene, 21820, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21820J3KMU2 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm21820J3KMU2 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm21820J3KMU2 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm21820J3KMU2 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm21820J3KMU2 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm21820J3KMU2 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm21820J3KMU2 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm21820J3KMU2 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm21820J3KMU2 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm21820J3KMU2 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm21820J3KMU2 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm21820J3KMU2 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm21820J3KMU2 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm21820J3KMU2 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm21820J3KMU2 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm21820J3KMU2 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm21820J3KMU2 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm21820J3KMU2 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm21820J3KMU2 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm21820J3KMU2 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm21820J3KMU2 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm21820J3KMU2 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm21820J3KMU2 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm21820J3KMU2 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm21820J3KMU2 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm21820J3KMU2 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm21820J3KMU2 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm21820J3KMU2 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm21820J3KMU2 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm21820J3KMU2 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm21820J3KMU2 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm21820J3KMU2 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm21820J3KMU2 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm21820J3KMU2 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm21820J3KMU2 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm21820J3KMU2 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm21820J3KMU2 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm21820J3KMU2 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm21820J3KMU2 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm21820J3KMU2 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm21820J3KMU2 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm21820J3KMU2 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm21820J3KMU2 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm21820J3KMU2 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm21820J3KMU2 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm21820J3KMU2 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm21820J3KMU2 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm21820J3KMU2 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm21820J3KMU2 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm21820J3KMU2 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm21820J3KMU2 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm21820J3KMU2 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm21820J3KMU2 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm21820J3KMU2 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm21820J3KMU2 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm21820J3KMU2 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm21820J3KMU2 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm21820J3KMU2 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm21820J3KMU2 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm21820J3KMU2 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm21820J3KMU2 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm21820J3KMU2 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm21820J3KMU2 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm21820J3KMU2 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm21820J3KMU2 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm21820J3KMU2 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm21820J3KMU2 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm21820J3KMU2 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm21820J3KMU2 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm21820J3KMU2 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm21820J3KMU2 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm21820J3KMU2 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm21820J3KMU2 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm21820J3KMU2 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm21820J3KMU2 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm21820J3KMU2 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm21820J3KMU2 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm21820J3KMU2 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm21820J3KMU2 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm21820J3KMU2 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm21820J3KMU2 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm21820J3KMU2 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm21820J3KMU2 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm21820J3KMU2 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm21820J3KMU2 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm21820J3KMU2 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm21820J3KMU2 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm21820J3KMU2 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm21820J3KMU2 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm21820J3KMU2 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm21820J3KMU2 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm21820J3KMU2 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm21820J3KMU2 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm21820J3KMU2 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm21820J3KMU2 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm21820J3KMU2 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm21820J3KMU2 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm21820J3KMU2 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm21820J3KMU2 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm21820J3KMU2 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
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