Protein–RNA interactions for Protein: G5E8Z2

Taf4b, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, mousemouse

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Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf4bG5E8Z2 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Taf4bG5E8Z2 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Taf4bG5E8Z2 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Taf4bG5E8Z2 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Taf4bG5E8Z2 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Taf4bG5E8Z2 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Taf4bG5E8Z2 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Taf4bG5E8Z2 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Taf4bG5E8Z2 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Taf4bG5E8Z2 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Taf4bG5E8Z2 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Taf4bG5E8Z2 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Taf4bG5E8Z2 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Taf4bG5E8Z2 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Taf4bG5E8Z2 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Taf4bG5E8Z2 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Taf4bG5E8Z2 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Taf4bG5E8Z2 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Taf4bG5E8Z2 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Taf4bG5E8Z2 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Taf4bG5E8Z2 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Taf4bG5E8Z2 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Taf4bG5E8Z2 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Taf4bG5E8Z2 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Taf4bG5E8Z2 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Taf4bG5E8Z2 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Taf4bG5E8Z2 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Taf4bG5E8Z2 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
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Taf4bG5E8Z2 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Taf4bG5E8Z2 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Taf4bG5E8Z2 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Taf4bG5E8Z2 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Taf4bG5E8Z2 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Taf4bG5E8Z2 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Taf4bG5E8Z2 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Taf4bG5E8Z2 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Taf4bG5E8Z2 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Taf4bG5E8Z2 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Taf4bG5E8Z2 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Taf4bG5E8Z2 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Taf4bG5E8Z2 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Taf4bG5E8Z2 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Taf4bG5E8Z2 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Taf4bG5E8Z2 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Taf4bG5E8Z2 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Taf4bG5E8Z2 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Taf4bG5E8Z2 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Taf4bG5E8Z2 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Taf4bG5E8Z2 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Taf4bG5E8Z2 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Taf4bG5E8Z2 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Taf4bG5E8Z2 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Taf4bG5E8Z2 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Taf4bG5E8Z2 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Taf4bG5E8Z2 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Taf4bG5E8Z2 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Taf4bG5E8Z2 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Taf4bG5E8Z2 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Taf4bG5E8Z2 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Taf4bG5E8Z2 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Taf4bG5E8Z2 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Taf4bG5E8Z2 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Taf4bG5E8Z2 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Taf4bG5E8Z2 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Taf4bG5E8Z2 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Taf4bG5E8Z2 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Taf4bG5E8Z2 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Taf4bG5E8Z2 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Taf4bG5E8Z2 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Taf4bG5E8Z2 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Taf4bG5E8Z2 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Taf4bG5E8Z2 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Taf4bG5E8Z2 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Taf4bG5E8Z2 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Taf4bG5E8Z2 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Taf4bG5E8Z2 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Taf4bG5E8Z2 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Taf4bG5E8Z2 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Taf4bG5E8Z2 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Taf4bG5E8Z2 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Taf4bG5E8Z2 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Taf4bG5E8Z2 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Taf4bG5E8Z2 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Taf4bG5E8Z2 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Taf4bG5E8Z2 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Taf4bG5E8Z2 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Taf4bG5E8Z2 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Taf4bG5E8Z2 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Taf4bG5E8Z2 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Taf4bG5E8Z2 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Taf4bG5E8Z2 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Taf4bG5E8Z2 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Taf4bG5E8Z2 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Taf4bG5E8Z2 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Taf4bG5E8Z2 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Taf4bG5E8Z2 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Taf4bG5E8Z2 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Taf4bG5E8Z2 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Taf4bG5E8Z2 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
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