Protein–RNA interactions for Protein: G3X8R9

Tmigd3, Transmembrane domain-containing protein TMIGD3, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmigd3G3X8R9 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tmigd3G3X8R9 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tmigd3G3X8R9 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tmigd3G3X8R9 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tmigd3G3X8R9 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tmigd3G3X8R9 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tmigd3G3X8R9 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tmigd3G3X8R9 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tmigd3G3X8R9 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tmigd3G3X8R9 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tmigd3G3X8R9 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tmigd3G3X8R9 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Tmigd3G3X8R9 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tmigd3G3X8R9 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tmigd3G3X8R9 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Tmigd3G3X8R9 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Tmigd3G3X8R9 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Tmigd3G3X8R9 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Tmigd3G3X8R9 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Tmigd3G3X8R9 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Tmigd3G3X8R9 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Tmigd3G3X8R9 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Tmigd3G3X8R9 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Tmigd3G3X8R9 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Tmigd3G3X8R9 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Tmigd3G3X8R9 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Tmigd3G3X8R9 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tmigd3G3X8R9 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tmigd3G3X8R9 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tmigd3G3X8R9 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tmigd3G3X8R9 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Tmigd3G3X8R9 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tmigd3G3X8R9 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Tmigd3G3X8R9 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tmigd3G3X8R9 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tmigd3G3X8R9 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tmigd3G3X8R9 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tmigd3G3X8R9 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tmigd3G3X8R9 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tmigd3G3X8R9 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tmigd3G3X8R9 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Tmigd3G3X8R9 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tmigd3G3X8R9 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tmigd3G3X8R9 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tmigd3G3X8R9 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tmigd3G3X8R9 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tmigd3G3X8R9 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tmigd3G3X8R9 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tmigd3G3X8R9 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tmigd3G3X8R9 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tmigd3G3X8R9 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tmigd3G3X8R9 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tmigd3G3X8R9 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tmigd3G3X8R9 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tmigd3G3X8R9 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Tmigd3G3X8R9 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tmigd3G3X8R9 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tmigd3G3X8R9 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tmigd3G3X8R9 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tmigd3G3X8R9 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tmigd3G3X8R9 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tmigd3G3X8R9 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tmigd3G3X8R9 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tmigd3G3X8R9 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tmigd3G3X8R9 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tmigd3G3X8R9 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tmigd3G3X8R9 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tmigd3G3X8R9 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tmigd3G3X8R9 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tmigd3G3X8R9 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tmigd3G3X8R9 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tmigd3G3X8R9 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tmigd3G3X8R9 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tmigd3G3X8R9 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tmigd3G3X8R9 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tmigd3G3X8R9 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tmigd3G3X8R9 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tmigd3G3X8R9 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tmigd3G3X8R9 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tmigd3G3X8R9 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tmigd3G3X8R9 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tmigd3G3X8R9 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tmigd3G3X8R9 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tmigd3G3X8R9 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tmigd3G3X8R9 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tmigd3G3X8R9 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tmigd3G3X8R9 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tmigd3G3X8R9 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tmigd3G3X8R9 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tmigd3G3X8R9 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tmigd3G3X8R9 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tmigd3G3X8R9 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tmigd3G3X8R9 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tmigd3G3X8R9 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tmigd3G3X8R9 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tmigd3G3X8R9 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Tmigd3G3X8R9 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Tmigd3G3X8R9 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Tmigd3G3X8R9 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Tmigd3G3X8R9 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.5 ms