Protein–RNA interactions for Protein: G3UY47

Vmn1r60, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r60G3UY47 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r60G3UY47 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r60G3UY47 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r60G3UY47 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r60G3UY47 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r60G3UY47 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r60G3UY47 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r60G3UY47 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r60G3UY47 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r60G3UY47 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r60G3UY47 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r60G3UY47 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r60G3UY47 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r60G3UY47 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r60G3UY47 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r60G3UY47 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r60G3UY47 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r60G3UY47 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r60G3UY47 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r60G3UY47 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r60G3UY47 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r60G3UY47 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r60G3UY47 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r60G3UY47 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r60G3UY47 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r60G3UY47 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r60G3UY47 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r60G3UY47 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r60G3UY47 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r60G3UY47 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r60G3UY47 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r60G3UY47 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r60G3UY47 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r60G3UY47 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r60G3UY47 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r60G3UY47 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r60G3UY47 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r60G3UY47 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r60G3UY47 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r60G3UY47 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r60G3UY47 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r60G3UY47 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r60G3UY47 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r60G3UY47 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r60G3UY47 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r60G3UY47 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r60G3UY47 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r60G3UY47 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r60G3UY47 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r60G3UY47 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r60G3UY47 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r60G3UY47 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r60G3UY47 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r60G3UY47 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r60G3UY47 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r60G3UY47 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r60G3UY47 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r60G3UY47 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r60G3UY47 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r60G3UY47 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r60G3UY47 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r60G3UY47 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r60G3UY47 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r60G3UY47 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r60G3UY47 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r60G3UY47 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r60G3UY47 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r60G3UY47 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r60G3UY47 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r60G3UY47 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r60G3UY47 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r60G3UY47 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r60G3UY47 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r60G3UY47 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r60G3UY47 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r60G3UY47 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r60G3UY47 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r60G3UY47 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r60G3UY47 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r60G3UY47 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r60G3UY47 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r60G3UY47 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r60G3UY47 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r60G3UY47 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r60G3UY47 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r60G3UY47 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r60G3UY47 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r60G3UY47 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r60G3UY47 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r60G3UY47 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r60G3UY47 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r60G3UY47 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r60G3UY47 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r60G3UY47 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r60G3UY47 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r60G3UY47 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r60G3UY47 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r60G3UY47 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r60G3UY47 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r60G3UY47 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms