Protein–RNA interactions for Protein: G3UXE9

Gm8909, Predicted gene 8909, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8909G3UXE9 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm8909G3UXE9 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm8909G3UXE9 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm8909G3UXE9 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm8909G3UXE9 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm8909G3UXE9 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm8909G3UXE9 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm8909G3UXE9 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm8909G3UXE9 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm8909G3UXE9 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm8909G3UXE9 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm8909G3UXE9 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm8909G3UXE9 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm8909G3UXE9 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm8909G3UXE9 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm8909G3UXE9 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm8909G3UXE9 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm8909G3UXE9 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm8909G3UXE9 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm8909G3UXE9 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm8909G3UXE9 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm8909G3UXE9 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm8909G3UXE9 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm8909G3UXE9 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm8909G3UXE9 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm8909G3UXE9 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm8909G3UXE9 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm8909G3UXE9 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm8909G3UXE9 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm8909G3UXE9 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm8909G3UXE9 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm8909G3UXE9 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm8909G3UXE9 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm8909G3UXE9 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm8909G3UXE9 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm8909G3UXE9 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm8909G3UXE9 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm8909G3UXE9 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm8909G3UXE9 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm8909G3UXE9 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm8909G3UXE9 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm8909G3UXE9 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm8909G3UXE9 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm8909G3UXE9 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm8909G3UXE9 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm8909G3UXE9 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm8909G3UXE9 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm8909G3UXE9 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm8909G3UXE9 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm8909G3UXE9 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm8909G3UXE9 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm8909G3UXE9 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm8909G3UXE9 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm8909G3UXE9 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm8909G3UXE9 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm8909G3UXE9 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm8909G3UXE9 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm8909G3UXE9 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm8909G3UXE9 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm8909G3UXE9 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm8909G3UXE9 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm8909G3UXE9 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm8909G3UXE9 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm8909G3UXE9 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm8909G3UXE9 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm8909G3UXE9 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm8909G3UXE9 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm8909G3UXE9 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm8909G3UXE9 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm8909G3UXE9 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm8909G3UXE9 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm8909G3UXE9 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm8909G3UXE9 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm8909G3UXE9 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm8909G3UXE9 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm8909G3UXE9 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm8909G3UXE9 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm8909G3UXE9 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm8909G3UXE9 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm8909G3UXE9 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm8909G3UXE9 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm8909G3UXE9 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm8909G3UXE9 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm8909G3UXE9 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm8909G3UXE9 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm8909G3UXE9 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm8909G3UXE9 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm8909G3UXE9 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm8909G3UXE9 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm8909G3UXE9 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm8909G3UXE9 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm8909G3UXE9 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm8909G3UXE9 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm8909G3UXE9 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm8909G3UXE9 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm8909G3UXE9 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm8909G3UXE9 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm8909G3UXE9 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm8909G3UXE9 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm8909G3UXE9 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms