Protein–RNA interactions for Protein: G3UXD1

Speer4c, Spermatogenesis-associated glutamate (E)-rich protein 4C, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer4cG3UXD1 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Speer4cG3UXD1 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Speer4cG3UXD1 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Speer4cG3UXD1 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Speer4cG3UXD1 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Speer4cG3UXD1 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Speer4cG3UXD1 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Speer4cG3UXD1 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Speer4cG3UXD1 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Speer4cG3UXD1 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Speer4cG3UXD1 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Speer4cG3UXD1 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Speer4cG3UXD1 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Speer4cG3UXD1 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Speer4cG3UXD1 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Speer4cG3UXD1 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Speer4cG3UXD1 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Speer4cG3UXD1 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Speer4cG3UXD1 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Speer4cG3UXD1 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Speer4cG3UXD1 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Speer4cG3UXD1 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Speer4cG3UXD1 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Speer4cG3UXD1 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Speer4cG3UXD1 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Speer4cG3UXD1 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Speer4cG3UXD1 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Speer4cG3UXD1 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Speer4cG3UXD1 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Speer4cG3UXD1 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Speer4cG3UXD1 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Speer4cG3UXD1 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Speer4cG3UXD1 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Speer4cG3UXD1 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Speer4cG3UXD1 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Speer4cG3UXD1 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Speer4cG3UXD1 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Speer4cG3UXD1 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Speer4cG3UXD1 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Speer4cG3UXD1 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Speer4cG3UXD1 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Speer4cG3UXD1 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Speer4cG3UXD1 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Speer4cG3UXD1 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Speer4cG3UXD1 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Speer4cG3UXD1 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Speer4cG3UXD1 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Speer4cG3UXD1 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Speer4cG3UXD1 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Speer4cG3UXD1 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Speer4cG3UXD1 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Speer4cG3UXD1 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Speer4cG3UXD1 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Speer4cG3UXD1 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Speer4cG3UXD1 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Speer4cG3UXD1 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Speer4cG3UXD1 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Speer4cG3UXD1 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Speer4cG3UXD1 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Speer4cG3UXD1 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Speer4cG3UXD1 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Speer4cG3UXD1 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Speer4cG3UXD1 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Speer4cG3UXD1 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Speer4cG3UXD1 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Speer4cG3UXD1 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Speer4cG3UXD1 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Speer4cG3UXD1 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Speer4cG3UXD1 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Speer4cG3UXD1 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Speer4cG3UXD1 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Speer4cG3UXD1 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Speer4cG3UXD1 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Speer4cG3UXD1 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Speer4cG3UXD1 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Speer4cG3UXD1 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Speer4cG3UXD1 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Speer4cG3UXD1 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Speer4cG3UXD1 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Speer4cG3UXD1 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Speer4cG3UXD1 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Speer4cG3UXD1 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Speer4cG3UXD1 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Speer4cG3UXD1 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Speer4cG3UXD1 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Speer4cG3UXD1 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Speer4cG3UXD1 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Speer4cG3UXD1 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Speer4cG3UXD1 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Speer4cG3UXD1 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Speer4cG3UXD1 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Speer4cG3UXD1 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Speer4cG3UXD1 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Speer4cG3UXD1 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Speer4cG3UXD1 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Speer4cG3UXD1 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Speer4cG3UXD1 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Speer4cG3UXD1 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Speer4cG3UXD1 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Speer4cG3UXD1 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87 ms