Protein–RNA interactions for Protein: F8VQC1

Srp72, Signal recognition particle subunit SRP72, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp72F8VQC1 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Srp72F8VQC1 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Srp72F8VQC1 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Srp72F8VQC1 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Srp72F8VQC1 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Srp72F8VQC1 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Srp72F8VQC1 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Srp72F8VQC1 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Srp72F8VQC1 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Srp72F8VQC1 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Srp72F8VQC1 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Srp72F8VQC1 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Srp72F8VQC1 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Srp72F8VQC1 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Srp72F8VQC1 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Srp72F8VQC1 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Srp72F8VQC1 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Srp72F8VQC1 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Srp72F8VQC1 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Srp72F8VQC1 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Srp72F8VQC1 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Srp72F8VQC1 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Srp72F8VQC1 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Srp72F8VQC1 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Srp72F8VQC1 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Srp72F8VQC1 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Srp72F8VQC1 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Srp72F8VQC1 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Srp72F8VQC1 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Srp72F8VQC1 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Srp72F8VQC1 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Srp72F8VQC1 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Srp72F8VQC1 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Srp72F8VQC1 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Srp72F8VQC1 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Srp72F8VQC1 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Srp72F8VQC1 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Srp72F8VQC1 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Srp72F8VQC1 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Srp72F8VQC1 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Srp72F8VQC1 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Srp72F8VQC1 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Srp72F8VQC1 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Srp72F8VQC1 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Srp72F8VQC1 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Srp72F8VQC1 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Srp72F8VQC1 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Srp72F8VQC1 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Srp72F8VQC1 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Srp72F8VQC1 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Srp72F8VQC1 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Srp72F8VQC1 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Srp72F8VQC1 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Srp72F8VQC1 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Srp72F8VQC1 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Srp72F8VQC1 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Srp72F8VQC1 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Srp72F8VQC1 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Srp72F8VQC1 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Srp72F8VQC1 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Srp72F8VQC1 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Srp72F8VQC1 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Srp72F8VQC1 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Srp72F8VQC1 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Srp72F8VQC1 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Srp72F8VQC1 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Srp72F8VQC1 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Srp72F8VQC1 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Srp72F8VQC1 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Srp72F8VQC1 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Srp72F8VQC1 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Srp72F8VQC1 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Srp72F8VQC1 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Srp72F8VQC1 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Srp72F8VQC1 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Srp72F8VQC1 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Srp72F8VQC1 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Srp72F8VQC1 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Srp72F8VQC1 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Srp72F8VQC1 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Srp72F8VQC1 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Srp72F8VQC1 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Srp72F8VQC1 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Srp72F8VQC1 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Srp72F8VQC1 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Srp72F8VQC1 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Srp72F8VQC1 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Srp72F8VQC1 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Srp72F8VQC1 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Srp72F8VQC1 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Srp72F8VQC1 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Srp72F8VQC1 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Srp72F8VQC1 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Srp72F8VQC1 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Srp72F8VQC1 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Srp72F8VQC1 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Srp72F8VQC1 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Srp72F8VQC1 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Srp72F8VQC1 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Srp72F8VQC1 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms