Protein–RNA interactions for Protein: F8VQ70

Scaper, S phase cyclin A-associated protein in the ER, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScaperF8VQ70 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ScaperF8VQ70 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ScaperF8VQ70 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ScaperF8VQ70 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ScaperF8VQ70 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ScaperF8VQ70 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
ScaperF8VQ70 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ScaperF8VQ70 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ScaperF8VQ70 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ScaperF8VQ70 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ScaperF8VQ70 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ScaperF8VQ70 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ScaperF8VQ70 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ScaperF8VQ70 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ScaperF8VQ70 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ScaperF8VQ70 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ScaperF8VQ70 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ScaperF8VQ70 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ScaperF8VQ70 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ScaperF8VQ70 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ScaperF8VQ70 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ScaperF8VQ70 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ScaperF8VQ70 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ScaperF8VQ70 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ScaperF8VQ70 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ScaperF8VQ70 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ScaperF8VQ70 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ScaperF8VQ70 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ScaperF8VQ70 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ScaperF8VQ70 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
ScaperF8VQ70 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ScaperF8VQ70 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ScaperF8VQ70 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ScaperF8VQ70 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ScaperF8VQ70 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ScaperF8VQ70 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ScaperF8VQ70 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ScaperF8VQ70 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ScaperF8VQ70 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ScaperF8VQ70 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ScaperF8VQ70 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ScaperF8VQ70 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ScaperF8VQ70 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ScaperF8VQ70 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ScaperF8VQ70 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ScaperF8VQ70 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ScaperF8VQ70 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ScaperF8VQ70 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ScaperF8VQ70 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ScaperF8VQ70 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ScaperF8VQ70 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ScaperF8VQ70 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ScaperF8VQ70 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ScaperF8VQ70 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ScaperF8VQ70 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
ScaperF8VQ70 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ScaperF8VQ70 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ScaperF8VQ70 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ScaperF8VQ70 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ScaperF8VQ70 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ScaperF8VQ70 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
ScaperF8VQ70 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
ScaperF8VQ70 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
ScaperF8VQ70 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ScaperF8VQ70 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
ScaperF8VQ70 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ScaperF8VQ70 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ScaperF8VQ70 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ScaperF8VQ70 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
ScaperF8VQ70 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ScaperF8VQ70 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ScaperF8VQ70 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ScaperF8VQ70 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ScaperF8VQ70 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ScaperF8VQ70 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ScaperF8VQ70 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ScaperF8VQ70 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ScaperF8VQ70 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ScaperF8VQ70 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ScaperF8VQ70 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ScaperF8VQ70 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ScaperF8VQ70 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
ScaperF8VQ70 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ScaperF8VQ70 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ScaperF8VQ70 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ScaperF8VQ70 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ScaperF8VQ70 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ScaperF8VQ70 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ScaperF8VQ70 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ScaperF8VQ70 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ScaperF8VQ70 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ScaperF8VQ70 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ScaperF8VQ70 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ScaperF8VQ70 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ScaperF8VQ70 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ScaperF8VQ70 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
ScaperF8VQ70 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ScaperF8VQ70 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ScaperF8VQ70 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ScaperF8VQ70 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms