Protein–RNA interactions for Protein: F8VQ07

5830473C10Rik, RIKEN cDNA 5830473C10 gene, mousemouse

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5830473C10RikF8VQ07 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
5830473C10RikF8VQ07 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
5830473C10RikF8VQ07 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
5830473C10RikF8VQ07 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
5830473C10RikF8VQ07 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
5830473C10RikF8VQ07 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
5830473C10RikF8VQ07 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
5830473C10RikF8VQ07 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
5830473C10RikF8VQ07 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
5830473C10RikF8VQ07 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
5830473C10RikF8VQ07 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
5830473C10RikF8VQ07 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
5830473C10RikF8VQ07 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
5830473C10RikF8VQ07 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
5830473C10RikF8VQ07 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
5830473C10RikF8VQ07 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
5830473C10RikF8VQ07 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
5830473C10RikF8VQ07 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
5830473C10RikF8VQ07 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
5830473C10RikF8VQ07 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
5830473C10RikF8VQ07 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
5830473C10RikF8VQ07 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
5830473C10RikF8VQ07 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
5830473C10RikF8VQ07 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
5830473C10RikF8VQ07 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
5830473C10RikF8VQ07 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
5830473C10RikF8VQ07 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
5830473C10RikF8VQ07 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
5830473C10RikF8VQ07 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
5830473C10RikF8VQ07 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
5830473C10RikF8VQ07 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
5830473C10RikF8VQ07 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
5830473C10RikF8VQ07 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
5830473C10RikF8VQ07 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
5830473C10RikF8VQ07 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
5830473C10RikF8VQ07 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
5830473C10RikF8VQ07 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
5830473C10RikF8VQ07 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
5830473C10RikF8VQ07 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
5830473C10RikF8VQ07 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
5830473C10RikF8VQ07 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
5830473C10RikF8VQ07 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
5830473C10RikF8VQ07 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
5830473C10RikF8VQ07 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
5830473C10RikF8VQ07 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
5830473C10RikF8VQ07 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
5830473C10RikF8VQ07 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
5830473C10RikF8VQ07 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
5830473C10RikF8VQ07 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
5830473C10RikF8VQ07 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
5830473C10RikF8VQ07 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
5830473C10RikF8VQ07 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
5830473C10RikF8VQ07 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
5830473C10RikF8VQ07 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
5830473C10RikF8VQ07 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
5830473C10RikF8VQ07 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
5830473C10RikF8VQ07 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
5830473C10RikF8VQ07 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
5830473C10RikF8VQ07 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
5830473C10RikF8VQ07 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
5830473C10RikF8VQ07 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
5830473C10RikF8VQ07 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
5830473C10RikF8VQ07 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
5830473C10RikF8VQ07 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
5830473C10RikF8VQ07 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
5830473C10RikF8VQ07 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
5830473C10RikF8VQ07 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
5830473C10RikF8VQ07 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
5830473C10RikF8VQ07 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
5830473C10RikF8VQ07 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
5830473C10RikF8VQ07 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
5830473C10RikF8VQ07 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
5830473C10RikF8VQ07 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
5830473C10RikF8VQ07 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
5830473C10RikF8VQ07 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
5830473C10RikF8VQ07 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
5830473C10RikF8VQ07 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
5830473C10RikF8VQ07 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
5830473C10RikF8VQ07 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
5830473C10RikF8VQ07 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
5830473C10RikF8VQ07 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
5830473C10RikF8VQ07 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
5830473C10RikF8VQ07 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
5830473C10RikF8VQ07 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
5830473C10RikF8VQ07 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
5830473C10RikF8VQ07 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
5830473C10RikF8VQ07 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
5830473C10RikF8VQ07 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
5830473C10RikF8VQ07 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
5830473C10RikF8VQ07 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
5830473C10RikF8VQ07 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
5830473C10RikF8VQ07 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
5830473C10RikF8VQ07 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
5830473C10RikF8VQ07 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
5830473C10RikF8VQ07 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
5830473C10RikF8VQ07 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
5830473C10RikF8VQ07 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
5830473C10RikF8VQ07 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
5830473C10RikF8VQ07 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
5830473C10RikF8VQ07 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms