Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN9

Gm28038, Predicted gene, 28038 (Fragment), mousemouse

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Length 126 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28038F7BCN9 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm28038F7BCN9 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm28038F7BCN9 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm28038F7BCN9 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm28038F7BCN9 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Gm28038F7BCN9 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Gm28038F7BCN9 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC13.83□□□□□ -0.19
Gm28038F7BCN9 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm28038F7BCN9 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm28038F7BCN9 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm28038F7BCN9 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm28038F7BCN9 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm28038F7BCN9 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm28038F7BCN9 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm28038F7BCN9 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm28038F7BCN9 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
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Gm28038F7BCN9 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm28038F7BCN9 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm28038F7BCN9 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm28038F7BCN9 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm28038F7BCN9 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm28038F7BCN9 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm28038F7BCN9 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm28038F7BCN9 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm28038F7BCN9 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm28038F7BCN9 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm28038F7BCN9 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm28038F7BCN9 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm28038F7BCN9 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm28038F7BCN9 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm28038F7BCN9 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm28038F7BCN9 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm28038F7BCN9 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm28038F7BCN9 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm28038F7BCN9 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm28038F7BCN9 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm28038F7BCN9 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm28038F7BCN9 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm28038F7BCN9 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm28038F7BCN9 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm28038F7BCN9 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm28038F7BCN9 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm28038F7BCN9 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm28038F7BCN9 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm28038F7BCN9 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm28038F7BCN9 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm28038F7BCN9 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm28038F7BCN9 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm28038F7BCN9 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm28038F7BCN9 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm28038F7BCN9 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm28038F7BCN9 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm28038F7BCN9 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm28038F7BCN9 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm28038F7BCN9 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
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Gm28038F7BCN9 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm28038F7BCN9 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm28038F7BCN9 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm28038F7BCN9 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
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Gm28038F7BCN9 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
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Gm28038F7BCN9 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
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Gm28038F7BCN9 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm28038F7BCN9 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm28038F7BCN9 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm28038F7BCN9 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm28038F7BCN9 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm28038F7BCN9 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm28038F7BCN9 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm28038F7BCN9 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm28038F7BCN9 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm28038F7BCN9 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm28038F7BCN9 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm28038F7BCN9 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm28038F7BCN9 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm28038F7BCN9 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm28038F7BCN9 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm28038F7BCN9 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm28038F7BCN9 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm28038F7BCN9 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm28038F7BCN9 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm28038F7BCN9 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm28038F7BCN9 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm28038F7BCN9 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm28038F7BCN9 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm28038F7BCN9 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm28038F7BCN9 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm28038F7BCN9 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm28038F7BCN9 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm28038F7BCN9 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm28038F7BCN9 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm28038F7BCN9 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm28038F7BCN9 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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