Protein–RNA interactions for Protein: F6WIE4

Gm10563, Predicted gene 10563, mousemouse

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10563F6WIE4 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gm10563F6WIE4 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gm10563F6WIE4 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gm10563F6WIE4 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gm10563F6WIE4 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Gm10563F6WIE4 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gm10563F6WIE4 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gm10563F6WIE4 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gm10563F6WIE4 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gm10563F6WIE4 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Gm10563F6WIE4 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gm10563F6WIE4 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Gm10563F6WIE4 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Gm10563F6WIE4 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Gm10563F6WIE4 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Gm10563F6WIE4 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Gm10563F6WIE4 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Gm10563F6WIE4 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Gm10563F6WIE4 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Gm10563F6WIE4 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Gm10563F6WIE4 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Gm10563F6WIE4 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Gm10563F6WIE4 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Gm10563F6WIE4 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gm10563F6WIE4 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gm10563F6WIE4 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gm10563F6WIE4 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gm10563F6WIE4 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gm10563F6WIE4 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gm10563F6WIE4 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gm10563F6WIE4 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gm10563F6WIE4 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gm10563F6WIE4 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gm10563F6WIE4 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gm10563F6WIE4 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Gm10563F6WIE4 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gm10563F6WIE4 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gm10563F6WIE4 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gm10563F6WIE4 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Gm10563F6WIE4 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Gm10563F6WIE4 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Gm10563F6WIE4 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Gm10563F6WIE4 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Gm10563F6WIE4 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Gm10563F6WIE4 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Gm10563F6WIE4 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Gm10563F6WIE4 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Gm10563F6WIE4 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Gm10563F6WIE4 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Gm10563F6WIE4 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Gm10563F6WIE4 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gm10563F6WIE4 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gm10563F6WIE4 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gm10563F6WIE4 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gm10563F6WIE4 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gm10563F6WIE4 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gm10563F6WIE4 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gm10563F6WIE4 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gm10563F6WIE4 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gm10563F6WIE4 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gm10563F6WIE4 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gm10563F6WIE4 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Gm10563F6WIE4 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gm10563F6WIE4 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gm10563F6WIE4 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gm10563F6WIE4 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gm10563F6WIE4 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gm10563F6WIE4 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Gm10563F6WIE4 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gm10563F6WIE4 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gm10563F6WIE4 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gm10563F6WIE4 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gm10563F6WIE4 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gm10563F6WIE4 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gm10563F6WIE4 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gm10563F6WIE4 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gm10563F6WIE4 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Gm10563F6WIE4 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gm10563F6WIE4 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gm10563F6WIE4 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Gm10563F6WIE4 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gm10563F6WIE4 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gm10563F6WIE4 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gm10563F6WIE4 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gm10563F6WIE4 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gm10563F6WIE4 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gm10563F6WIE4 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gm10563F6WIE4 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gm10563F6WIE4 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gm10563F6WIE4 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Gm10563F6WIE4 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gm10563F6WIE4 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Gm10563F6WIE4 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Gm10563F6WIE4 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gm10563F6WIE4 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gm10563F6WIE4 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gm10563F6WIE4 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gm10563F6WIE4 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Gm10563F6WIE4 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Gm10563F6WIE4 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms