Protein–RNA interactions for Protein: F6V0H0

Pagr1b, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1B (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pagr1bF6V0H0 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Pagr1bF6V0H0 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Pagr1bF6V0H0 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pagr1bF6V0H0 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pagr1bF6V0H0 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pagr1bF6V0H0 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pagr1bF6V0H0 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pagr1bF6V0H0 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pagr1bF6V0H0 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pagr1bF6V0H0 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pagr1bF6V0H0 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pagr1bF6V0H0 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pagr1bF6V0H0 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pagr1bF6V0H0 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pagr1bF6V0H0 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pagr1bF6V0H0 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pagr1bF6V0H0 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pagr1bF6V0H0 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pagr1bF6V0H0 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pagr1bF6V0H0 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pagr1bF6V0H0 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pagr1bF6V0H0 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pagr1bF6V0H0 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Pagr1bF6V0H0 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pagr1bF6V0H0 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pagr1bF6V0H0 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pagr1bF6V0H0 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pagr1bF6V0H0 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pagr1bF6V0H0 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Pagr1bF6V0H0 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Pagr1bF6V0H0 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pagr1bF6V0H0 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pagr1bF6V0H0 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pagr1bF6V0H0 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Pagr1bF6V0H0 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pagr1bF6V0H0 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pagr1bF6V0H0 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pagr1bF6V0H0 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pagr1bF6V0H0 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pagr1bF6V0H0 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pagr1bF6V0H0 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pagr1bF6V0H0 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pagr1bF6V0H0 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pagr1bF6V0H0 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pagr1bF6V0H0 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pagr1bF6V0H0 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pagr1bF6V0H0 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pagr1bF6V0H0 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pagr1bF6V0H0 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pagr1bF6V0H0 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pagr1bF6V0H0 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pagr1bF6V0H0 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pagr1bF6V0H0 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pagr1bF6V0H0 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pagr1bF6V0H0 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pagr1bF6V0H0 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pagr1bF6V0H0 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pagr1bF6V0H0 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pagr1bF6V0H0 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pagr1bF6V0H0 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Pagr1bF6V0H0 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pagr1bF6V0H0 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pagr1bF6V0H0 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Pagr1bF6V0H0 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pagr1bF6V0H0 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pagr1bF6V0H0 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pagr1bF6V0H0 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pagr1bF6V0H0 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pagr1bF6V0H0 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pagr1bF6V0H0 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pagr1bF6V0H0 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pagr1bF6V0H0 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pagr1bF6V0H0 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pagr1bF6V0H0 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pagr1bF6V0H0 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pagr1bF6V0H0 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pagr1bF6V0H0 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pagr1bF6V0H0 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pagr1bF6V0H0 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pagr1bF6V0H0 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Pagr1bF6V0H0 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Pagr1bF6V0H0 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pagr1bF6V0H0 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pagr1bF6V0H0 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pagr1bF6V0H0 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Pagr1bF6V0H0 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pagr1bF6V0H0 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pagr1bF6V0H0 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pagr1bF6V0H0 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pagr1bF6V0H0 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pagr1bF6V0H0 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pagr1bF6V0H0 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pagr1bF6V0H0 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pagr1bF6V0H0 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pagr1bF6V0H0 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pagr1bF6V0H0 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pagr1bF6V0H0 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pagr1bF6V0H0 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Pagr1bF6V0H0 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pagr1bF6V0H0 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms