Protein–RNA interactions for Protein: F6RGI3

Gm340, Predicted gene 340, mousemouse

Predictions only

Length 1,242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm340F6RGI3 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm340F6RGI3 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm340F6RGI3 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm340F6RGI3 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm340F6RGI3 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm340F6RGI3 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm340F6RGI3 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm340F6RGI3 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm340F6RGI3 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gm340F6RGI3 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gm340F6RGI3 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm340F6RGI3 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm340F6RGI3 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm340F6RGI3 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm340F6RGI3 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm340F6RGI3 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm340F6RGI3 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm340F6RGI3 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm340F6RGI3 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm340F6RGI3 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm340F6RGI3 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm340F6RGI3 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm340F6RGI3 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm340F6RGI3 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm340F6RGI3 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm340F6RGI3 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm340F6RGI3 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm340F6RGI3 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm340F6RGI3 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm340F6RGI3 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm340F6RGI3 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm340F6RGI3 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm340F6RGI3 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm340F6RGI3 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm340F6RGI3 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm340F6RGI3 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm340F6RGI3 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm340F6RGI3 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm340F6RGI3 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm340F6RGI3 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm340F6RGI3 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm340F6RGI3 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm340F6RGI3 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm340F6RGI3 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm340F6RGI3 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm340F6RGI3 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm340F6RGI3 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm340F6RGI3 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm340F6RGI3 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm340F6RGI3 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm340F6RGI3 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm340F6RGI3 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm340F6RGI3 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm340F6RGI3 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm340F6RGI3 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm340F6RGI3 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm340F6RGI3 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm340F6RGI3 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm340F6RGI3 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm340F6RGI3 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm340F6RGI3 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm340F6RGI3 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm340F6RGI3 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm340F6RGI3 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm340F6RGI3 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm340F6RGI3 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm340F6RGI3 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm340F6RGI3 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm340F6RGI3 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm340F6RGI3 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm340F6RGI3 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm340F6RGI3 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm340F6RGI3 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm340F6RGI3 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm340F6RGI3 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm340F6RGI3 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm340F6RGI3 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm340F6RGI3 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm340F6RGI3 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm340F6RGI3 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm340F6RGI3 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm340F6RGI3 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm340F6RGI3 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm340F6RGI3 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm340F6RGI3 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm340F6RGI3 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm340F6RGI3 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm340F6RGI3 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm340F6RGI3 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm340F6RGI3 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm340F6RGI3 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm340F6RGI3 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm340F6RGI3 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm340F6RGI3 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm340F6RGI3 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm340F6RGI3 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm340F6RGI3 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm340F6RGI3 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Gm340F6RGI3 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Gm340F6RGI3 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.8 ms