Protein–RNA interactions for Protein: F6Q785

Gm29094, Predicted gene 29094 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm29094F6Q785 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gm29094F6Q785 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Gm29094F6Q785 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gm29094F6Q785 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gm29094F6Q785 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gm29094F6Q785 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gm29094F6Q785 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm29094F6Q785 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm29094F6Q785 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm29094F6Q785 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm29094F6Q785 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm29094F6Q785 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm29094F6Q785 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm29094F6Q785 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm29094F6Q785 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm29094F6Q785 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm29094F6Q785 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm29094F6Q785 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm29094F6Q785 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm29094F6Q785 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm29094F6Q785 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm29094F6Q785 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm29094F6Q785 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm29094F6Q785 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm29094F6Q785 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm29094F6Q785 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm29094F6Q785 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm29094F6Q785 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm29094F6Q785 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm29094F6Q785 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm29094F6Q785 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm29094F6Q785 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm29094F6Q785 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm29094F6Q785 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm29094F6Q785 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm29094F6Q785 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm29094F6Q785 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm29094F6Q785 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm29094F6Q785 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm29094F6Q785 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm29094F6Q785 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm29094F6Q785 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm29094F6Q785 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm29094F6Q785 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm29094F6Q785 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm29094F6Q785 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm29094F6Q785 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm29094F6Q785 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm29094F6Q785 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm29094F6Q785 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm29094F6Q785 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm29094F6Q785 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm29094F6Q785 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm29094F6Q785 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm29094F6Q785 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm29094F6Q785 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm29094F6Q785 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm29094F6Q785 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm29094F6Q785 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm29094F6Q785 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm29094F6Q785 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm29094F6Q785 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm29094F6Q785 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm29094F6Q785 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm29094F6Q785 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm29094F6Q785 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm29094F6Q785 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm29094F6Q785 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm29094F6Q785 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm29094F6Q785 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gm29094F6Q785 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gm29094F6Q785 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gm29094F6Q785 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gm29094F6Q785 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gm29094F6Q785 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gm29094F6Q785 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gm29094F6Q785 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Gm29094F6Q785 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Gm29094F6Q785 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm29094F6Q785 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm29094F6Q785 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm29094F6Q785 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm29094F6Q785 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm29094F6Q785 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm29094F6Q785 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm29094F6Q785 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm29094F6Q785 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm29094F6Q785 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm29094F6Q785 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm29094F6Q785 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm29094F6Q785 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm29094F6Q785 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm29094F6Q785 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm29094F6Q785 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm29094F6Q785 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm29094F6Q785 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm29094F6Q785 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm29094F6Q785 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm29094F6Q785 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm29094F6Q785 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms