Protein–RNA interactions for Protein: F2Z461

Herc6, E3 ISG15--protein ligase Herc6, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc6F2Z461 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Herc6F2Z461 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Herc6F2Z461 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Herc6F2Z461 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Herc6F2Z461 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Herc6F2Z461 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Herc6F2Z461 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Herc6F2Z461 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Herc6F2Z461 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Herc6F2Z461 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Herc6F2Z461 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Herc6F2Z461 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Herc6F2Z461 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Herc6F2Z461 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Herc6F2Z461 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Herc6F2Z461 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Herc6F2Z461 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Herc6F2Z461 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Herc6F2Z461 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Herc6F2Z461 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Herc6F2Z461 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Herc6F2Z461 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Herc6F2Z461 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Herc6F2Z461 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Herc6F2Z461 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Herc6F2Z461 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Herc6F2Z461 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Herc6F2Z461 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Herc6F2Z461 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Herc6F2Z461 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Herc6F2Z461 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Herc6F2Z461 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Herc6F2Z461 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Herc6F2Z461 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Herc6F2Z461 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Herc6F2Z461 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Herc6F2Z461 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Herc6F2Z461 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Herc6F2Z461 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Herc6F2Z461 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Herc6F2Z461 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Herc6F2Z461 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Herc6F2Z461 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Herc6F2Z461 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Herc6F2Z461 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Herc6F2Z461 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Herc6F2Z461 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Herc6F2Z461 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Herc6F2Z461 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Herc6F2Z461 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Herc6F2Z461 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Herc6F2Z461 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Herc6F2Z461 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Herc6F2Z461 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Herc6F2Z461 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Herc6F2Z461 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Herc6F2Z461 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Herc6F2Z461 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Herc6F2Z461 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Herc6F2Z461 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Herc6F2Z461 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Herc6F2Z461 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Herc6F2Z461 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Herc6F2Z461 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Herc6F2Z461 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Herc6F2Z461 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Herc6F2Z461 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Herc6F2Z461 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Herc6F2Z461 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Herc6F2Z461 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Herc6F2Z461 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Herc6F2Z461 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Herc6F2Z461 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Herc6F2Z461 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Herc6F2Z461 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Herc6F2Z461 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Herc6F2Z461 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Herc6F2Z461 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Herc6F2Z461 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Herc6F2Z461 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Herc6F2Z461 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Herc6F2Z461 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Herc6F2Z461 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Herc6F2Z461 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Herc6F2Z461 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Herc6F2Z461 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Herc6F2Z461 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Herc6F2Z461 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Herc6F2Z461 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Herc6F2Z461 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Herc6F2Z461 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Herc6F2Z461 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Herc6F2Z461 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Herc6F2Z461 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Herc6F2Z461 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Herc6F2Z461 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Herc6F2Z461 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Herc6F2Z461 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Herc6F2Z461 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Herc6F2Z461 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms