Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9Q6

Cdh18, Cadherin 18, mousemouse

Predictions only

Length 790 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh18E9Q9Q6 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cdh18E9Q9Q6 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Cdh18E9Q9Q6 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cdh18E9Q9Q6 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cdh18E9Q9Q6 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cdh18E9Q9Q6 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cdh18E9Q9Q6 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cdh18E9Q9Q6 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cdh18E9Q9Q6 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cdh18E9Q9Q6 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cdh18E9Q9Q6 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cdh18E9Q9Q6 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cdh18E9Q9Q6 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cdh18E9Q9Q6 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cdh18E9Q9Q6 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Cdh18E9Q9Q6 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
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Cdh18E9Q9Q6 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cdh18E9Q9Q6 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cdh18E9Q9Q6 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cdh18E9Q9Q6 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cdh18E9Q9Q6 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cdh18E9Q9Q6 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cdh18E9Q9Q6 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cdh18E9Q9Q6 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cdh18E9Q9Q6 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cdh18E9Q9Q6 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cdh18E9Q9Q6 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Cdh18E9Q9Q6 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cdh18E9Q9Q6 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cdh18E9Q9Q6 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cdh18E9Q9Q6 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cdh18E9Q9Q6 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cdh18E9Q9Q6 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cdh18E9Q9Q6 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cdh18E9Q9Q6 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cdh18E9Q9Q6 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cdh18E9Q9Q6 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cdh18E9Q9Q6 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cdh18E9Q9Q6 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cdh18E9Q9Q6 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
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Cdh18E9Q9Q6 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cdh18E9Q9Q6 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
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Cdh18E9Q9Q6 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
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Cdh18E9Q9Q6 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cdh18E9Q9Q6 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cdh18E9Q9Q6 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cdh18E9Q9Q6 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cdh18E9Q9Q6 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
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Cdh18E9Q9Q6 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cdh18E9Q9Q6 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
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Cdh18E9Q9Q6 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cdh18E9Q9Q6 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cdh18E9Q9Q6 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cdh18E9Q9Q6 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cdh18E9Q9Q6 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cdh18E9Q9Q6 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cdh18E9Q9Q6 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cdh18E9Q9Q6 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cdh18E9Q9Q6 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cdh18E9Q9Q6 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Cdh18E9Q9Q6 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cdh18E9Q9Q6 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cdh18E9Q9Q6 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cdh18E9Q9Q6 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cdh18E9Q9Q6 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cdh18E9Q9Q6 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cdh18E9Q9Q6 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cdh18E9Q9Q6 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cdh18E9Q9Q6 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cdh18E9Q9Q6 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cdh18E9Q9Q6 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cdh18E9Q9Q6 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cdh18E9Q9Q6 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cdh18E9Q9Q6 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cdh18E9Q9Q6 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cdh18E9Q9Q6 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cdh18E9Q9Q6 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cdh18E9Q9Q6 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
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