Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5G2

Pcdhb9, Protocadherin beta 9, mousemouse

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdhb9E9Q5G2 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pcdhb9E9Q5G2 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pcdhb9E9Q5G2 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pcdhb9E9Q5G2 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pcdhb9E9Q5G2 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pcdhb9E9Q5G2 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pcdhb9E9Q5G2 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pcdhb9E9Q5G2 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pcdhb9E9Q5G2 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pcdhb9E9Q5G2 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pcdhb9E9Q5G2 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pcdhb9E9Q5G2 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pcdhb9E9Q5G2 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Pcdhb9E9Q5G2 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Pcdhb9E9Q5G2 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pcdhb9E9Q5G2 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pcdhb9E9Q5G2 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pcdhb9E9Q5G2 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pcdhb9E9Q5G2 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pcdhb9E9Q5G2 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pcdhb9E9Q5G2 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pcdhb9E9Q5G2 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pcdhb9E9Q5G2 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pcdhb9E9Q5G2 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Pcdhb9E9Q5G2 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pcdhb9E9Q5G2 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pcdhb9E9Q5G2 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pcdhb9E9Q5G2 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pcdhb9E9Q5G2 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pcdhb9E9Q5G2 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pcdhb9E9Q5G2 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pcdhb9E9Q5G2 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pcdhb9E9Q5G2 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pcdhb9E9Q5G2 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Pcdhb9E9Q5G2 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pcdhb9E9Q5G2 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pcdhb9E9Q5G2 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pcdhb9E9Q5G2 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pcdhb9E9Q5G2 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pcdhb9E9Q5G2 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pcdhb9E9Q5G2 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pcdhb9E9Q5G2 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pcdhb9E9Q5G2 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pcdhb9E9Q5G2 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pcdhb9E9Q5G2 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Pcdhb9E9Q5G2 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pcdhb9E9Q5G2 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pcdhb9E9Q5G2 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Pcdhb9E9Q5G2 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pcdhb9E9Q5G2 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pcdhb9E9Q5G2 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pcdhb9E9Q5G2 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pcdhb9E9Q5G2 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pcdhb9E9Q5G2 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pcdhb9E9Q5G2 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pcdhb9E9Q5G2 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pcdhb9E9Q5G2 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pcdhb9E9Q5G2 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pcdhb9E9Q5G2 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pcdhb9E9Q5G2 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pcdhb9E9Q5G2 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Pcdhb9E9Q5G2 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Pcdhb9E9Q5G2 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pcdhb9E9Q5G2 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pcdhb9E9Q5G2 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Pcdhb9E9Q5G2 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pcdhb9E9Q5G2 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pcdhb9E9Q5G2 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pcdhb9E9Q5G2 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Pcdhb9E9Q5G2 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pcdhb9E9Q5G2 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pcdhb9E9Q5G2 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pcdhb9E9Q5G2 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pcdhb9E9Q5G2 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pcdhb9E9Q5G2 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Pcdhb9E9Q5G2 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Pcdhb9E9Q5G2 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Pcdhb9E9Q5G2 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pcdhb9E9Q5G2 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pcdhb9E9Q5G2 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pcdhb9E9Q5G2 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Pcdhb9E9Q5G2 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pcdhb9E9Q5G2 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pcdhb9E9Q5G2 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pcdhb9E9Q5G2 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pcdhb9E9Q5G2 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Pcdhb9E9Q5G2 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pcdhb9E9Q5G2 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pcdhb9E9Q5G2 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pcdhb9E9Q5G2 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pcdhb9E9Q5G2 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Pcdhb9E9Q5G2 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pcdhb9E9Q5G2 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pcdhb9E9Q5G2 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pcdhb9E9Q5G2 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Pcdhb9E9Q5G2 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pcdhb9E9Q5G2 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pcdhb9E9Q5G2 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pcdhb9E9Q5G2 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pcdhb9E9Q5G2 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms