Protein–RNA interactions for Protein: E9Q548

Gm20518, Predicted gene 20518, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20518E9Q548 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm20518E9Q548 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm20518E9Q548 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm20518E9Q548 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm20518E9Q548 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm20518E9Q548 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm20518E9Q548 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm20518E9Q548 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm20518E9Q548 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm20518E9Q548 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm20518E9Q548 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm20518E9Q548 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm20518E9Q548 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm20518E9Q548 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm20518E9Q548 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm20518E9Q548 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm20518E9Q548 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm20518E9Q548 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm20518E9Q548 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm20518E9Q548 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm20518E9Q548 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm20518E9Q548 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm20518E9Q548 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm20518E9Q548 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm20518E9Q548 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm20518E9Q548 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm20518E9Q548 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm20518E9Q548 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm20518E9Q548 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm20518E9Q548 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm20518E9Q548 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm20518E9Q548 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm20518E9Q548 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm20518E9Q548 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm20518E9Q548 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm20518E9Q548 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm20518E9Q548 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm20518E9Q548 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm20518E9Q548 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm20518E9Q548 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm20518E9Q548 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm20518E9Q548 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm20518E9Q548 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm20518E9Q548 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm20518E9Q548 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm20518E9Q548 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm20518E9Q548 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm20518E9Q548 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm20518E9Q548 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm20518E9Q548 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm20518E9Q548 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm20518E9Q548 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gm20518E9Q548 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gm20518E9Q548 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gm20518E9Q548 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gm20518E9Q548 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gm20518E9Q548 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gm20518E9Q548 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gm20518E9Q548 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gm20518E9Q548 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm20518E9Q548 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm20518E9Q548 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm20518E9Q548 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm20518E9Q548 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm20518E9Q548 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm20518E9Q548 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm20518E9Q548 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm20518E9Q548 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm20518E9Q548 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm20518E9Q548 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm20518E9Q548 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm20518E9Q548 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm20518E9Q548 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm20518E9Q548 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm20518E9Q548 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm20518E9Q548 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm20518E9Q548 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm20518E9Q548 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm20518E9Q548 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm20518E9Q548 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm20518E9Q548 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm20518E9Q548 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm20518E9Q548 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm20518E9Q548 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm20518E9Q548 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm20518E9Q548 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm20518E9Q548 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm20518E9Q548 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm20518E9Q548 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm20518E9Q548 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm20518E9Q548 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm20518E9Q548 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm20518E9Q548 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm20518E9Q548 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm20518E9Q548 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm20518E9Q548 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm20518E9Q548 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm20518E9Q548 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm20518E9Q548 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm20518E9Q548 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms