Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0V3

Vmn1r68, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r68E9Q0V3 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vmn1r68E9Q0V3 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vmn1r68E9Q0V3 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vmn1r68E9Q0V3 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Vmn1r68E9Q0V3 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vmn1r68E9Q0V3 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vmn1r68E9Q0V3 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vmn1r68E9Q0V3 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vmn1r68E9Q0V3 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vmn1r68E9Q0V3 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vmn1r68E9Q0V3 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Vmn1r68E9Q0V3 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vmn1r68E9Q0V3 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vmn1r68E9Q0V3 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vmn1r68E9Q0V3 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vmn1r68E9Q0V3 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vmn1r68E9Q0V3 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vmn1r68E9Q0V3 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vmn1r68E9Q0V3 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vmn1r68E9Q0V3 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vmn1r68E9Q0V3 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vmn1r68E9Q0V3 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vmn1r68E9Q0V3 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vmn1r68E9Q0V3 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vmn1r68E9Q0V3 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vmn1r68E9Q0V3 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vmn1r68E9Q0V3 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vmn1r68E9Q0V3 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vmn1r68E9Q0V3 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vmn1r68E9Q0V3 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vmn1r68E9Q0V3 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vmn1r68E9Q0V3 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vmn1r68E9Q0V3 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vmn1r68E9Q0V3 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Vmn1r68E9Q0V3 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Vmn1r68E9Q0V3 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vmn1r68E9Q0V3 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vmn1r68E9Q0V3 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Vmn1r68E9Q0V3 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vmn1r68E9Q0V3 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vmn1r68E9Q0V3 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vmn1r68E9Q0V3 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Vmn1r68E9Q0V3 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vmn1r68E9Q0V3 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vmn1r68E9Q0V3 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vmn1r68E9Q0V3 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vmn1r68E9Q0V3 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vmn1r68E9Q0V3 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vmn1r68E9Q0V3 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vmn1r68E9Q0V3 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vmn1r68E9Q0V3 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vmn1r68E9Q0V3 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Vmn1r68E9Q0V3 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vmn1r68E9Q0V3 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Vmn1r68E9Q0V3 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vmn1r68E9Q0V3 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vmn1r68E9Q0V3 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vmn1r68E9Q0V3 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vmn1r68E9Q0V3 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vmn1r68E9Q0V3 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vmn1r68E9Q0V3 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vmn1r68E9Q0V3 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vmn1r68E9Q0V3 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vmn1r68E9Q0V3 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Vmn1r68E9Q0V3 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vmn1r68E9Q0V3 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Vmn1r68E9Q0V3 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vmn1r68E9Q0V3 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vmn1r68E9Q0V3 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vmn1r68E9Q0V3 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Vmn1r68E9Q0V3 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Vmn1r68E9Q0V3 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Vmn1r68E9Q0V3 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Vmn1r68E9Q0V3 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Vmn1r68E9Q0V3 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmn1r68E9Q0V3 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmn1r68E9Q0V3 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmn1r68E9Q0V3 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmn1r68E9Q0V3 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmn1r68E9Q0V3 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmn1r68E9Q0V3 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmn1r68E9Q0V3 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmn1r68E9Q0V3 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmn1r68E9Q0V3 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmn1r68E9Q0V3 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmn1r68E9Q0V3 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmn1r68E9Q0V3 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmn1r68E9Q0V3 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmn1r68E9Q0V3 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r68E9Q0V3 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r68E9Q0V3 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r68E9Q0V3 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r68E9Q0V3 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r68E9Q0V3 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r68E9Q0V3 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r68E9Q0V3 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r68E9Q0V3 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r68E9Q0V3 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r68E9Q0V3 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r68E9Q0V3 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.4 ms