Protein–RNA interactions for Protein: E9Q053

Gm9972, Predicted gene 9972, mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm9972E9Q053 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm9972E9Q053 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm9972E9Q053 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm9972E9Q053 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm9972E9Q053 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm9972E9Q053 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm9972E9Q053 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm9972E9Q053 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm9972E9Q053 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm9972E9Q053 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm9972E9Q053 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm9972E9Q053 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm9972E9Q053 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm9972E9Q053 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm9972E9Q053 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm9972E9Q053 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm9972E9Q053 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm9972E9Q053 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm9972E9Q053 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm9972E9Q053 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm9972E9Q053 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm9972E9Q053 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm9972E9Q053 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm9972E9Q053 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm9972E9Q053 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm9972E9Q053 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm9972E9Q053 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm9972E9Q053 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm9972E9Q053 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm9972E9Q053 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm9972E9Q053 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm9972E9Q053 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm9972E9Q053 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm9972E9Q053 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm9972E9Q053 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm9972E9Q053 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm9972E9Q053 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm9972E9Q053 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm9972E9Q053 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm9972E9Q053 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm9972E9Q053 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm9972E9Q053 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm9972E9Q053 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm9972E9Q053 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm9972E9Q053 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm9972E9Q053 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm9972E9Q053 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm9972E9Q053 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm9972E9Q053 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm9972E9Q053 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm9972E9Q053 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm9972E9Q053 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm9972E9Q053 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm9972E9Q053 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm9972E9Q053 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm9972E9Q053 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm9972E9Q053 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm9972E9Q053 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm9972E9Q053 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm9972E9Q053 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm9972E9Q053 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm9972E9Q053 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm9972E9Q053 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm9972E9Q053 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm9972E9Q053 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm9972E9Q053 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm9972E9Q053 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm9972E9Q053 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm9972E9Q053 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm9972E9Q053 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm9972E9Q053 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm9972E9Q053 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm9972E9Q053 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm9972E9Q053 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm9972E9Q053 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm9972E9Q053 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm9972E9Q053 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm9972E9Q053 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm9972E9Q053 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm9972E9Q053 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm9972E9Q053 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm9972E9Q053 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm9972E9Q053 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm9972E9Q053 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm9972E9Q053 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm9972E9Q053 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm9972E9Q053 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm9972E9Q053 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm9972E9Q053 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm9972E9Q053 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm9972E9Q053 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm9972E9Q053 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm9972E9Q053 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm9972E9Q053 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm9972E9Q053 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm9972E9Q053 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm9972E9Q053 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm9972E9Q053 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm9972E9Q053 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm9972E9Q053 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms