Protein–RNA interactions for Protein: E9PZM4

Chd2, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd2E9PZM4 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Chd2E9PZM4 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Chd2E9PZM4 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Chd2E9PZM4 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Chd2E9PZM4 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Chd2E9PZM4 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Chd2E9PZM4 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Chd2E9PZM4 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Chd2E9PZM4 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Chd2E9PZM4 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Chd2E9PZM4 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Chd2E9PZM4 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Chd2E9PZM4 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Chd2E9PZM4 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Chd2E9PZM4 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Chd2E9PZM4 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Chd2E9PZM4 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Chd2E9PZM4 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Chd2E9PZM4 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Chd2E9PZM4 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Chd2E9PZM4 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Chd2E9PZM4 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Chd2E9PZM4 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Chd2E9PZM4 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Chd2E9PZM4 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Chd2E9PZM4 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Chd2E9PZM4 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Chd2E9PZM4 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Chd2E9PZM4 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Chd2E9PZM4 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Chd2E9PZM4 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Chd2E9PZM4 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Chd2E9PZM4 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Chd2E9PZM4 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Chd2E9PZM4 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Chd2E9PZM4 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Chd2E9PZM4 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Chd2E9PZM4 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Chd2E9PZM4 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Chd2E9PZM4 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Chd2E9PZM4 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Chd2E9PZM4 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Chd2E9PZM4 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Chd2E9PZM4 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Chd2E9PZM4 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Chd2E9PZM4 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Chd2E9PZM4 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Chd2E9PZM4 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Chd2E9PZM4 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Chd2E9PZM4 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Chd2E9PZM4 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Chd2E9PZM4 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Chd2E9PZM4 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Chd2E9PZM4 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Chd2E9PZM4 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Chd2E9PZM4 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Chd2E9PZM4 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Chd2E9PZM4 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Chd2E9PZM4 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Chd2E9PZM4 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Chd2E9PZM4 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Chd2E9PZM4 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Chd2E9PZM4 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Chd2E9PZM4 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Chd2E9PZM4 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Chd2E9PZM4 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Chd2E9PZM4 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Chd2E9PZM4 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Chd2E9PZM4 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Chd2E9PZM4 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Chd2E9PZM4 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Chd2E9PZM4 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Chd2E9PZM4 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Chd2E9PZM4 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Chd2E9PZM4 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Chd2E9PZM4 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Chd2E9PZM4 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Chd2E9PZM4 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Chd2E9PZM4 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Chd2E9PZM4 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Chd2E9PZM4 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Chd2E9PZM4 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Chd2E9PZM4 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Chd2E9PZM4 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Chd2E9PZM4 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Chd2E9PZM4 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Chd2E9PZM4 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Chd2E9PZM4 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Chd2E9PZM4 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Chd2E9PZM4 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Chd2E9PZM4 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Chd2E9PZM4 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Chd2E9PZM4 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Chd2E9PZM4 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Chd2E9PZM4 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Chd2E9PZM4 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Chd2E9PZM4 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Chd2E9PZM4 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Chd2E9PZM4 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Chd2E9PZM4 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms