Protein–RNA interactions for Protein: E9PVA8

Gcn1, eIF-2-alpha kinase activator GCN1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,671 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcn1E9PVA8 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gcn1E9PVA8 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gcn1E9PVA8 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gcn1E9PVA8 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gcn1E9PVA8 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gcn1E9PVA8 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gcn1E9PVA8 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gcn1E9PVA8 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gcn1E9PVA8 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gcn1E9PVA8 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Gcn1E9PVA8 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gcn1E9PVA8 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gcn1E9PVA8 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gcn1E9PVA8 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gcn1E9PVA8 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gcn1E9PVA8 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gcn1E9PVA8 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gcn1E9PVA8 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gcn1E9PVA8 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gcn1E9PVA8 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gcn1E9PVA8 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gcn1E9PVA8 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Gcn1E9PVA8 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gcn1E9PVA8 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gcn1E9PVA8 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gcn1E9PVA8 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Gcn1E9PVA8 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gcn1E9PVA8 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gcn1E9PVA8 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gcn1E9PVA8 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gcn1E9PVA8 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gcn1E9PVA8 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gcn1E9PVA8 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Gcn1E9PVA8 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gcn1E9PVA8 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gcn1E9PVA8 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gcn1E9PVA8 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gcn1E9PVA8 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gcn1E9PVA8 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gcn1E9PVA8 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gcn1E9PVA8 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gcn1E9PVA8 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gcn1E9PVA8 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gcn1E9PVA8 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gcn1E9PVA8 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gcn1E9PVA8 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gcn1E9PVA8 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gcn1E9PVA8 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gcn1E9PVA8 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gcn1E9PVA8 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gcn1E9PVA8 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gcn1E9PVA8 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gcn1E9PVA8 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gcn1E9PVA8 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gcn1E9PVA8 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gcn1E9PVA8 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gcn1E9PVA8 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gcn1E9PVA8 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gcn1E9PVA8 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gcn1E9PVA8 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gcn1E9PVA8 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gcn1E9PVA8 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gcn1E9PVA8 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gcn1E9PVA8 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gcn1E9PVA8 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gcn1E9PVA8 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gcn1E9PVA8 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gcn1E9PVA8 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gcn1E9PVA8 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gcn1E9PVA8 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gcn1E9PVA8 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gcn1E9PVA8 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gcn1E9PVA8 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gcn1E9PVA8 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gcn1E9PVA8 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gcn1E9PVA8 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gcn1E9PVA8 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gcn1E9PVA8 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gcn1E9PVA8 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gcn1E9PVA8 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gcn1E9PVA8 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gcn1E9PVA8 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gcn1E9PVA8 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gcn1E9PVA8 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Gcn1E9PVA8 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gcn1E9PVA8 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gcn1E9PVA8 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gcn1E9PVA8 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gcn1E9PVA8 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gcn1E9PVA8 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Gcn1E9PVA8 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gcn1E9PVA8 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gcn1E9PVA8 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gcn1E9PVA8 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gcn1E9PVA8 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Gcn1E9PVA8 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gcn1E9PVA8 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gcn1E9PVA8 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gcn1E9PVA8 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gcn1E9PVA8 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms