Protein–RNA interactions for Protein: D3Z5W0

Atp6ap1l, ATPase, H+-transporting, lysosomal accessory protein 1-like, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6ap1lD3Z5W0 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atp6ap1lD3Z5W0 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atp6ap1lD3Z5W0 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atp6ap1lD3Z5W0 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atp6ap1lD3Z5W0 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atp6ap1lD3Z5W0 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atp6ap1lD3Z5W0 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atp6ap1lD3Z5W0 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atp6ap1lD3Z5W0 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atp6ap1lD3Z5W0 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atp6ap1lD3Z5W0 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atp6ap1lD3Z5W0 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atp6ap1lD3Z5W0 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atp6ap1lD3Z5W0 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atp6ap1lD3Z5W0 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atp6ap1lD3Z5W0 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atp6ap1lD3Z5W0 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atp6ap1lD3Z5W0 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atp6ap1lD3Z5W0 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Atp6ap1lD3Z5W0 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atp6ap1lD3Z5W0 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atp6ap1lD3Z5W0 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atp6ap1lD3Z5W0 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atp6ap1lD3Z5W0 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atp6ap1lD3Z5W0 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atp6ap1lD3Z5W0 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atp6ap1lD3Z5W0 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Atp6ap1lD3Z5W0 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atp6ap1lD3Z5W0 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atp6ap1lD3Z5W0 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atp6ap1lD3Z5W0 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atp6ap1lD3Z5W0 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atp6ap1lD3Z5W0 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atp6ap1lD3Z5W0 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atp6ap1lD3Z5W0 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atp6ap1lD3Z5W0 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atp6ap1lD3Z5W0 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atp6ap1lD3Z5W0 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atp6ap1lD3Z5W0 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atp6ap1lD3Z5W0 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atp6ap1lD3Z5W0 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Atp6ap1lD3Z5W0 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atp6ap1lD3Z5W0 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atp6ap1lD3Z5W0 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atp6ap1lD3Z5W0 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atp6ap1lD3Z5W0 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atp6ap1lD3Z5W0 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atp6ap1lD3Z5W0 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atp6ap1lD3Z5W0 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atp6ap1lD3Z5W0 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atp6ap1lD3Z5W0 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atp6ap1lD3Z5W0 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atp6ap1lD3Z5W0 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atp6ap1lD3Z5W0 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atp6ap1lD3Z5W0 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atp6ap1lD3Z5W0 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atp6ap1lD3Z5W0 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atp6ap1lD3Z5W0 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atp6ap1lD3Z5W0 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atp6ap1lD3Z5W0 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atp6ap1lD3Z5W0 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atp6ap1lD3Z5W0 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atp6ap1lD3Z5W0 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atp6ap1lD3Z5W0 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atp6ap1lD3Z5W0 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Atp6ap1lD3Z5W0 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atp6ap1lD3Z5W0 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atp6ap1lD3Z5W0 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atp6ap1lD3Z5W0 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atp6ap1lD3Z5W0 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atp6ap1lD3Z5W0 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atp6ap1lD3Z5W0 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atp6ap1lD3Z5W0 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atp6ap1lD3Z5W0 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Atp6ap1lD3Z5W0 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atp6ap1lD3Z5W0 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Atp6ap1lD3Z5W0 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atp6ap1lD3Z5W0 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atp6ap1lD3Z5W0 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atp6ap1lD3Z5W0 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atp6ap1lD3Z5W0 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Atp6ap1lD3Z5W0 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atp6ap1lD3Z5W0 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atp6ap1lD3Z5W0 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Atp6ap1lD3Z5W0 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atp6ap1lD3Z5W0 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atp6ap1lD3Z5W0 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atp6ap1lD3Z5W0 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Atp6ap1lD3Z5W0 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atp6ap1lD3Z5W0 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atp6ap1lD3Z5W0 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms