Protein–RNA interactions for Protein: D3Z460

Gm1330, Predicted gene 1330, mousemouse

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm1330D3Z460 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm1330D3Z460 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm1330D3Z460 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm1330D3Z460 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm1330D3Z460 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm1330D3Z460 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm1330D3Z460 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm1330D3Z460 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm1330D3Z460 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm1330D3Z460 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm1330D3Z460 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm1330D3Z460 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm1330D3Z460 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm1330D3Z460 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm1330D3Z460 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm1330D3Z460 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm1330D3Z460 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm1330D3Z460 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm1330D3Z460 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm1330D3Z460 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm1330D3Z460 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm1330D3Z460 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm1330D3Z460 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm1330D3Z460 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm1330D3Z460 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm1330D3Z460 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm1330D3Z460 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm1330D3Z460 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm1330D3Z460 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm1330D3Z460 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm1330D3Z460 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm1330D3Z460 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm1330D3Z460 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm1330D3Z460 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm1330D3Z460 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm1330D3Z460 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm1330D3Z460 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm1330D3Z460 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm1330D3Z460 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm1330D3Z460 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm1330D3Z460 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm1330D3Z460 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm1330D3Z460 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm1330D3Z460 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm1330D3Z460 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm1330D3Z460 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm1330D3Z460 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm1330D3Z460 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm1330D3Z460 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm1330D3Z460 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm1330D3Z460 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm1330D3Z460 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm1330D3Z460 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm1330D3Z460 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm1330D3Z460 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm1330D3Z460 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm1330D3Z460 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm1330D3Z460 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm1330D3Z460 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm1330D3Z460 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm1330D3Z460 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm1330D3Z460 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm1330D3Z460 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm1330D3Z460 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm1330D3Z460 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm1330D3Z460 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm1330D3Z460 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm1330D3Z460 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm1330D3Z460 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm1330D3Z460 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm1330D3Z460 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm1330D3Z460 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm1330D3Z460 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm1330D3Z460 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm1330D3Z460 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm1330D3Z460 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm1330D3Z460 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm1330D3Z460 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm1330D3Z460 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm1330D3Z460 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm1330D3Z460 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm1330D3Z460 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm1330D3Z460 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm1330D3Z460 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm1330D3Z460 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm1330D3Z460 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm1330D3Z460 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm1330D3Z460 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm1330D3Z460 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm1330D3Z460 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm1330D3Z460 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm1330D3Z460 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm1330D3Z460 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm1330D3Z460 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm1330D3Z460 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm1330D3Z460 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm1330D3Z460 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm1330D3Z460 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm1330D3Z460 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm1330D3Z460 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms