Protein–RNA interactions for Protein: D3Z3U4

9630041A04Rik, RIKEN cDNA 9630041A04 gene, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
9630041A04RikD3Z3U4 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
9630041A04RikD3Z3U4 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
9630041A04RikD3Z3U4 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
9630041A04RikD3Z3U4 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
9630041A04RikD3Z3U4 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
9630041A04RikD3Z3U4 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
9630041A04RikD3Z3U4 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
9630041A04RikD3Z3U4 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
9630041A04RikD3Z3U4 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
9630041A04RikD3Z3U4 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
9630041A04RikD3Z3U4 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
9630041A04RikD3Z3U4 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
9630041A04RikD3Z3U4 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
9630041A04RikD3Z3U4 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
9630041A04RikD3Z3U4 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
9630041A04RikD3Z3U4 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
9630041A04RikD3Z3U4 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
9630041A04RikD3Z3U4 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
9630041A04RikD3Z3U4 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
9630041A04RikD3Z3U4 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
9630041A04RikD3Z3U4 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
9630041A04RikD3Z3U4 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
9630041A04RikD3Z3U4 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
9630041A04RikD3Z3U4 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
9630041A04RikD3Z3U4 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
9630041A04RikD3Z3U4 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
9630041A04RikD3Z3U4 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
9630041A04RikD3Z3U4 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
9630041A04RikD3Z3U4 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
9630041A04RikD3Z3U4 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
9630041A04RikD3Z3U4 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
9630041A04RikD3Z3U4 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
9630041A04RikD3Z3U4 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
9630041A04RikD3Z3U4 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
9630041A04RikD3Z3U4 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
9630041A04RikD3Z3U4 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
9630041A04RikD3Z3U4 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
9630041A04RikD3Z3U4 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
9630041A04RikD3Z3U4 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
9630041A04RikD3Z3U4 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
9630041A04RikD3Z3U4 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
9630041A04RikD3Z3U4 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
9630041A04RikD3Z3U4 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
9630041A04RikD3Z3U4 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
9630041A04RikD3Z3U4 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
9630041A04RikD3Z3U4 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
9630041A04RikD3Z3U4 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
9630041A04RikD3Z3U4 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
9630041A04RikD3Z3U4 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
9630041A04RikD3Z3U4 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
9630041A04RikD3Z3U4 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
9630041A04RikD3Z3U4 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
9630041A04RikD3Z3U4 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
9630041A04RikD3Z3U4 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
9630041A04RikD3Z3U4 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
9630041A04RikD3Z3U4 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
9630041A04RikD3Z3U4 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
9630041A04RikD3Z3U4 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
9630041A04RikD3Z3U4 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
9630041A04RikD3Z3U4 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
9630041A04RikD3Z3U4 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
9630041A04RikD3Z3U4 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
9630041A04RikD3Z3U4 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
9630041A04RikD3Z3U4 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
9630041A04RikD3Z3U4 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
9630041A04RikD3Z3U4 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
9630041A04RikD3Z3U4 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
9630041A04RikD3Z3U4 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
9630041A04RikD3Z3U4 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
9630041A04RikD3Z3U4 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
9630041A04RikD3Z3U4 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
9630041A04RikD3Z3U4 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
9630041A04RikD3Z3U4 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
9630041A04RikD3Z3U4 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
9630041A04RikD3Z3U4 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
9630041A04RikD3Z3U4 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
9630041A04RikD3Z3U4 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
9630041A04RikD3Z3U4 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
9630041A04RikD3Z3U4 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
9630041A04RikD3Z3U4 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
9630041A04RikD3Z3U4 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
9630041A04RikD3Z3U4 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
9630041A04RikD3Z3U4 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
9630041A04RikD3Z3U4 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
9630041A04RikD3Z3U4 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
9630041A04RikD3Z3U4 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
9630041A04RikD3Z3U4 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
9630041A04RikD3Z3U4 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
9630041A04RikD3Z3U4 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
9630041A04RikD3Z3U4 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
9630041A04RikD3Z3U4 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
9630041A04RikD3Z3U4 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
9630041A04RikD3Z3U4 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
9630041A04RikD3Z3U4 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
9630041A04RikD3Z3U4 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
9630041A04RikD3Z3U4 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
9630041A04RikD3Z3U4 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
9630041A04RikD3Z3U4 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
9630041A04RikD3Z3U4 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
9630041A04RikD3Z3U4 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms