Protein–RNA interactions for Protein: D3YXE9

BC048679, cDNA sequence BC048679, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC048679D3YXE9 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
BC048679D3YXE9 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
BC048679D3YXE9 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
BC048679D3YXE9 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
BC048679D3YXE9 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
BC048679D3YXE9 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
BC048679D3YXE9 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
BC048679D3YXE9 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
BC048679D3YXE9 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
BC048679D3YXE9 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
BC048679D3YXE9 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
BC048679D3YXE9 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
BC048679D3YXE9 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
BC048679D3YXE9 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
BC048679D3YXE9 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
BC048679D3YXE9 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
BC048679D3YXE9 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
BC048679D3YXE9 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
BC048679D3YXE9 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
BC048679D3YXE9 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
BC048679D3YXE9 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
BC048679D3YXE9 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
BC048679D3YXE9 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
BC048679D3YXE9 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
BC048679D3YXE9 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
BC048679D3YXE9 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
BC048679D3YXE9 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
BC048679D3YXE9 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
BC048679D3YXE9 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
BC048679D3YXE9 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
BC048679D3YXE9 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
BC048679D3YXE9 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BC048679D3YXE9 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BC048679D3YXE9 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BC048679D3YXE9 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BC048679D3YXE9 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BC048679D3YXE9 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
BC048679D3YXE9 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BC048679D3YXE9 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BC048679D3YXE9 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
BC048679D3YXE9 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BC048679D3YXE9 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BC048679D3YXE9 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
BC048679D3YXE9 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BC048679D3YXE9 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BC048679D3YXE9 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BC048679D3YXE9 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BC048679D3YXE9 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BC048679D3YXE9 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BC048679D3YXE9 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BC048679D3YXE9 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BC048679D3YXE9 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BC048679D3YXE9 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
BC048679D3YXE9 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BC048679D3YXE9 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BC048679D3YXE9 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BC048679D3YXE9 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BC048679D3YXE9 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BC048679D3YXE9 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BC048679D3YXE9 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BC048679D3YXE9 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BC048679D3YXE9 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BC048679D3YXE9 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BC048679D3YXE9 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BC048679D3YXE9 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BC048679D3YXE9 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BC048679D3YXE9 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BC048679D3YXE9 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BC048679D3YXE9 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BC048679D3YXE9 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BC048679D3YXE9 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BC048679D3YXE9 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BC048679D3YXE9 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BC048679D3YXE9 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BC048679D3YXE9 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BC048679D3YXE9 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BC048679D3YXE9 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BC048679D3YXE9 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BC048679D3YXE9 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BC048679D3YXE9 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BC048679D3YXE9 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BC048679D3YXE9 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BC048679D3YXE9 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BC048679D3YXE9 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BC048679D3YXE9 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BC048679D3YXE9 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BC048679D3YXE9 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BC048679D3YXE9 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BC048679D3YXE9 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BC048679D3YXE9 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BC048679D3YXE9 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BC048679D3YXE9 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BC048679D3YXE9 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BC048679D3YXE9 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BC048679D3YXE9 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BC048679D3YXE9 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BC048679D3YXE9 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
BC048679D3YXE9 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BC048679D3YXE9 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BC048679D3YXE9 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms