Protein–RNA interactions for Protein: C6EQI3

Gm17333, ASL1 fusion protein, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17333C6EQI3 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm17333C6EQI3 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm17333C6EQI3 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm17333C6EQI3 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm17333C6EQI3 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm17333C6EQI3 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm17333C6EQI3 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm17333C6EQI3 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm17333C6EQI3 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm17333C6EQI3 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm17333C6EQI3 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm17333C6EQI3 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm17333C6EQI3 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm17333C6EQI3 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm17333C6EQI3 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm17333C6EQI3 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm17333C6EQI3 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm17333C6EQI3 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm17333C6EQI3 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm17333C6EQI3 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm17333C6EQI3 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm17333C6EQI3 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm17333C6EQI3 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm17333C6EQI3 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm17333C6EQI3 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm17333C6EQI3 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm17333C6EQI3 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm17333C6EQI3 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm17333C6EQI3 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm17333C6EQI3 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm17333C6EQI3 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm17333C6EQI3 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm17333C6EQI3 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm17333C6EQI3 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm17333C6EQI3 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm17333C6EQI3 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm17333C6EQI3 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm17333C6EQI3 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm17333C6EQI3 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm17333C6EQI3 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm17333C6EQI3 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm17333C6EQI3 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm17333C6EQI3 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm17333C6EQI3 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm17333C6EQI3 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm17333C6EQI3 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm17333C6EQI3 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm17333C6EQI3 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm17333C6EQI3 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm17333C6EQI3 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm17333C6EQI3 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm17333C6EQI3 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm17333C6EQI3 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm17333C6EQI3 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm17333C6EQI3 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm17333C6EQI3 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm17333C6EQI3 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm17333C6EQI3 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm17333C6EQI3 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm17333C6EQI3 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm17333C6EQI3 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm17333C6EQI3 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm17333C6EQI3 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
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Gm17333C6EQI3 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm17333C6EQI3 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm17333C6EQI3 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm17333C6EQI3 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm17333C6EQI3 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm17333C6EQI3 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm17333C6EQI3 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm17333C6EQI3 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm17333C6EQI3 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm17333C6EQI3 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm17333C6EQI3 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm17333C6EQI3 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm17333C6EQI3 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm17333C6EQI3 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm17333C6EQI3 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm17333C6EQI3 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm17333C6EQI3 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm17333C6EQI3 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm17333C6EQI3 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm17333C6EQI3 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm17333C6EQI3 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm17333C6EQI3 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm17333C6EQI3 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm17333C6EQI3 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm17333C6EQI3 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Gm17333C6EQI3 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm17333C6EQI3 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm17333C6EQI3 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm17333C6EQI3 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm17333C6EQI3 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm17333C6EQI3 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
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