Protein–RNA interactions for Protein: C0LLJ0

Kpna7, Importin subunit alpha-8, mousemouse

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna7C0LLJ0 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Kpna7C0LLJ0 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Kpna7C0LLJ0 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Kpna7C0LLJ0 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Kpna7C0LLJ0 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Kpna7C0LLJ0 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Kpna7C0LLJ0 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Kpna7C0LLJ0 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Kpna7C0LLJ0 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Kpna7C0LLJ0 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Kpna7C0LLJ0 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Kpna7C0LLJ0 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Kpna7C0LLJ0 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Kpna7C0LLJ0 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Kpna7C0LLJ0 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Kpna7C0LLJ0 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Kpna7C0LLJ0 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Kpna7C0LLJ0 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Kpna7C0LLJ0 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Kpna7C0LLJ0 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Kpna7C0LLJ0 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Kpna7C0LLJ0 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Kpna7C0LLJ0 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Kpna7C0LLJ0 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Kpna7C0LLJ0 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Kpna7C0LLJ0 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Kpna7C0LLJ0 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Kpna7C0LLJ0 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Kpna7C0LLJ0 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Kpna7C0LLJ0 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Kpna7C0LLJ0 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Kpna7C0LLJ0 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Kpna7C0LLJ0 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Kpna7C0LLJ0 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Kpna7C0LLJ0 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Kpna7C0LLJ0 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Kpna7C0LLJ0 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Kpna7C0LLJ0 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Kpna7C0LLJ0 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Kpna7C0LLJ0 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Kpna7C0LLJ0 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Kpna7C0LLJ0 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Kpna7C0LLJ0 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Kpna7C0LLJ0 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Kpna7C0LLJ0 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Kpna7C0LLJ0 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Kpna7C0LLJ0 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Kpna7C0LLJ0 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Kpna7C0LLJ0 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Kpna7C0LLJ0 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Kpna7C0LLJ0 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Kpna7C0LLJ0 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Kpna7C0LLJ0 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Kpna7C0LLJ0 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Kpna7C0LLJ0 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Kpna7C0LLJ0 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Kpna7C0LLJ0 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Kpna7C0LLJ0 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Kpna7C0LLJ0 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Kpna7C0LLJ0 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Kpna7C0LLJ0 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Kpna7C0LLJ0 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Kpna7C0LLJ0 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Kpna7C0LLJ0 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Kpna7C0LLJ0 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Kpna7C0LLJ0 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Kpna7C0LLJ0 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Kpna7C0LLJ0 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Kpna7C0LLJ0 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Kpna7C0LLJ0 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Kpna7C0LLJ0 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Kpna7C0LLJ0 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Kpna7C0LLJ0 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Kpna7C0LLJ0 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Kpna7C0LLJ0 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Kpna7C0LLJ0 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Kpna7C0LLJ0 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Kpna7C0LLJ0 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Kpna7C0LLJ0 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Kpna7C0LLJ0 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Kpna7C0LLJ0 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Kpna7C0LLJ0 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Kpna7C0LLJ0 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Kpna7C0LLJ0 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Kpna7C0LLJ0 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Kpna7C0LLJ0 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Kpna7C0LLJ0 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Kpna7C0LLJ0 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Kpna7C0LLJ0 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Kpna7C0LLJ0 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Kpna7C0LLJ0 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Kpna7C0LLJ0 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Kpna7C0LLJ0 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Kpna7C0LLJ0 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Kpna7C0LLJ0 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Kpna7C0LLJ0 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Kpna7C0LLJ0 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Kpna7C0LLJ0 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Kpna7C0LLJ0 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Kpna7C0LLJ0 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms