Protein–RNA interactions for Protein: B9EK86

Vmn1r180, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r180B9EK86 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r180B9EK86 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r180B9EK86 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r180B9EK86 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r180B9EK86 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r180B9EK86 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r180B9EK86 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r180B9EK86 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r180B9EK86 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r180B9EK86 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r180B9EK86 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r180B9EK86 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r180B9EK86 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r180B9EK86 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r180B9EK86 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r180B9EK86 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vmn1r180B9EK86 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vmn1r180B9EK86 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vmn1r180B9EK86 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vmn1r180B9EK86 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vmn1r180B9EK86 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vmn1r180B9EK86 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vmn1r180B9EK86 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vmn1r180B9EK86 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Vmn1r180B9EK86 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r180B9EK86 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r180B9EK86 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r180B9EK86 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r180B9EK86 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r180B9EK86 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r180B9EK86 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r180B9EK86 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r180B9EK86 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r180B9EK86 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r180B9EK86 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r180B9EK86 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r180B9EK86 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r180B9EK86 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r180B9EK86 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r180B9EK86 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r180B9EK86 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r180B9EK86 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r180B9EK86 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r180B9EK86 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r180B9EK86 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r180B9EK86 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r180B9EK86 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r180B9EK86 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r180B9EK86 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r180B9EK86 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r180B9EK86 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r180B9EK86 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r180B9EK86 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r180B9EK86 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r180B9EK86 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r180B9EK86 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r180B9EK86 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r180B9EK86 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r180B9EK86 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r180B9EK86 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r180B9EK86 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r180B9EK86 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r180B9EK86 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r180B9EK86 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r180B9EK86 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r180B9EK86 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r180B9EK86 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r180B9EK86 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r180B9EK86 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r180B9EK86 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r180B9EK86 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r180B9EK86 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r180B9EK86 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r180B9EK86 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r180B9EK86 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r180B9EK86 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r180B9EK86 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r180B9EK86 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r180B9EK86 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r180B9EK86 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r180B9EK86 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r180B9EK86 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r180B9EK86 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r180B9EK86 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r180B9EK86 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r180B9EK86 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r180B9EK86 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r180B9EK86 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r180B9EK86 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r180B9EK86 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r180B9EK86 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r180B9EK86 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r180B9EK86 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r180B9EK86 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r180B9EK86 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r180B9EK86 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r180B9EK86 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r180B9EK86 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r180B9EK86 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r180B9EK86 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.1 ms